| 犬冠状病毒南京株M基因的同源重组分析 |
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| 引用本文： | 王玉燕,陆承平.犬冠状病毒南京株M基因的同源重组分析[J].中国病毒学,2005,20(3):262-267. |
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| 作者姓名： | 王玉燕 陆承平 |
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| 作者单位： | 南京农业大学,农业部动物疫病诊断及免疫重点实验室,江苏南京,210095 |
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| 基金项目： | 上海科技兴农重点公关项目(农科攻字(2003)第D-1号);"江苏省高等学校研究生创新计划"资助项目. |
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| 摘 要： | 对来自腹泻犬粪样的犬冠状病毒(CCV)南京株NJ17株及参考株1-71的M基因进行了克隆、测序,并与GenBank中所有已知CCV毒株及同亚群的猪冠状病毒(TGEV)和猫冠状病毒(FCoV)代表株的M基因进行了同源性比较和系统进化分析,同时对M蛋白的结构和功能进行了预测分析.结果表明,CCV1-71与近年在中国分离到的CCV毒株V1、V2及大熊猫源的毒株具有98.9%～99.5%的同源性,说明这些毒株可能是来自同一毒株的准种.NJ17与其他中国分离株及国外分离株的同源性为87.0%～91.9%,显示国内可能存在一个相对独立进化的CCV毒株.序列比较发现,所有CCV毒株在可能的同源重组"热点"区内都有一个CTTTAG序列,与鸡传染性支气管炎病毒同源重组模板交换位点附近的特征序列相似.CCV NJ17株M蛋白在N端50氨基酸序列与FCoV 79-1683同源性高,而在后212氨基酸序列与TGEV同源性高,提示该毒株可能在M基因上曾经发生过不同病毒的同源重组.CCV M蛋白的结构及功能预测表明,所有毒株都具有分泌型信号肽,有4个螺旋跨膜区,N末端和C末端均位于膜内.M蛋白的两末端具有较强的抗原性,M蛋白上存在多种功能性氨基酸修饰位点且相对保守.N末端的氨基酸变异很大,但是功能性修饰位点相对保守,提示N末端的功能可能与构象有关.
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| 关 键 词： | 犬冠状病毒 M蛋白 同源重组 |
| 文章编号： | 1003-5125(2005)03-0262-06 |
| 修稿时间： | 2004年11月9日 |
Recombination Analysis of M Protein of a Canine Coronavirus Wild Strain Isolated From Nanjing City |
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| WANG Yu-yan,LU Cheng-ping.Recombination Analysis of M Protein of a Canine Coronavirus Wild Strain Isolated From Nanjing City[J].Virologica Sinica,2005,20(3):262-267. |
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| Authors: | WANG Yu-yan LU Cheng-ping |
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