HGV广东株和香港株NS5区部分基因的克隆及序列分析 |
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引用本文: | 马会慧,杨绍基,李刚,陈雪娟,廖家杰,姚集鲁.HGV广东株和香港株NS5区部分基因的克隆及序列分析[J].中国病毒学,1999,14(1). |
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作者姓名: | 马会慧 杨绍基 李刚 陈雪娟 廖家杰 姚集鲁 |
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作者单位: | 1. 中山医科大学传染病学教研室,广州,510630 2. 香港大学玛丽医院胃肠肝病科,香港 |
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基金项目: | 中国科学院资助项目,广东省医学科研项目 |
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摘 要: | 采用HGV NS5特异的2对引物,对两个香港株和一个广东株HGV-RNA进行逆转录套式PCR扩增,PCR产物克隆入pUC19,重组质粒转化DH5α和JM109菌株.PCR和酶切法鉴定阳性克隆,双脱氧链末端终止法测定核苷酸序列并进行同源性分析.结果发现核苷酸变异呈散在分布,三株间核苷酸和氨基酸序列同源性分别为93.3%~94%及97%~99.2%,与已报道的中国株(CN)相比,则同源性分别为90%~91.2%和94%~96.3%,与美国株(PNF2161及R10291)相比,为87.1%~89.5%和95.2%~97%,而与西非株(GBV-C)相比,则达91.4%~93.8%和97%~97.9%.提示HGV NS5区核苷酸和氨基酸序列相对保守,不同HGV株存在一定的地区差异.
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关 键 词: | 庚型肝炎病毒 聚合酶链反应 DNA序列测定 分子克隆 |
Molecular cloning and sequencing the NS5 genomic region of HGV Guangdong and Hong Kong strains |
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