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斗鱼属鱼类亲缘关系的Cyt b基因序列和RAPD分析
引用本文:王培欣,罗建仁,白俊杰,叶星,胡隐昌,汪学杰.斗鱼属鱼类亲缘关系的Cyt b基因序列和RAPD分析[J].动物学杂志,2009,44(5):14-23.
作者姓名:王培欣  罗建仁  白俊杰  叶星  胡隐昌  汪学杰
作者单位:1. 中国水产科学研究院珠江水产研究所,广州,510380;上海海洋大学水产与生命学院,上海,201303
2. 中国水产科学研究院珠江水产研究所,广州,510380
基金项目:广东淡水鱼类种质资源库建设项目 
摘    要:采用mtDNA Cyt b基因序列分析和RAPD两种分子标记技术,研究了中国分布的叉尾斗鱼(Macropodus opercularis)、圆尾斗鱼(M.chinensis)和香港斗鱼(M.hongkongensis)以及越南的红鳍斗鱼(M.erythropterus)4种鱼类之间的亲缘关系.获得4种斗鱼14条Cyt b基因全序列(1 155 bp),结合GenBank中搜索到的近缘物种同源序列进行分析.从133条随机引物中筛选到36条引物,在优化的反应条件下,10个群体96个个体共扩增出清晰稳定的条带749条,构建矩阵进行分析和聚类.基于Cyt b全序列以邻接法和最小进化法构建的系统树及RAPD数据UPGMA聚类分析的结果都显示,香港斗鱼和红鳍斗鱼先聚为一分支,再与叉尾斗鱼聚类,圆尾斗鱼处于外缘.本研究结果反映了圆尾斗鱼与其他斗鱼的亲缘关系较远,种间遗传距离为0.184 5~0.225 3(Cyt b)和0.653 6~0.746 5(RAPD),两者为同一单系群中两个独立演化的自然类群;香港斗鱼与叉尾斗鱼间遗传分化明显,Cyt b碱基差异为11.00%,RAFD遗传距离达0.577 7,支持其为独立物种的观点,且香港斗鱼群体间遗传差异较大,Cyt b碱基差异为3.12%,RAPD遗传距离0.060 1;叉尾斗鱼群体间Nei's基因多样度和Shannon信息指数分别为0.058 2和0.086 9,而各群体内的数值分别为0.016 1~0.031 7和0.023 5~0.046 7,表明遗传差异主要来自群体间,并按分布流域分别聚类.

关 键 词:斗鱼属  亲缘关系
收稿时间:2/9/2009 12:00:00 AM
修稿时间:2009/4/22 0:00:00

Cytochrome b Complete Sequences and RAPD Analysis of the Phylogenetic Relationships among the Fishes of the Genus Macropodus
WANG Pei-Xin,LUO Jian-Ren,BAI Jun-Jie,YE Xing,HU Yin-Chang and WANG Xue-Jie.Cytochrome b Complete Sequences and RAPD Analysis of the Phylogenetic Relationships among the Fishes of the Genus Macropodus[J].Chinese Journal of Zoology,2009,44(5):14-23.
Authors:WANG Pei-Xin  LUO Jian-Ren  BAI Jun-Jie  YE Xing  HU Yin-Chang and WANG Xue-Jie
Institution:WANG Pei-Xin LUO Jian-Ren BAI Jun-Jie YE Xing HU Yin-Chang WANG Xue-Jie( Pearl River Fisheries Research Institute,Chinese Academy of Fishery Sciences,Guangzhou 510380, College of Fisheries , Life Science,Shanghai Ocean University,Shanghai 201303,China)
Abstract:In this study,mitochondrial cytochrome b(Cyt b) gene sequencing and random amplified polymorphic DNA(RAPD) technique were applied to study the phylogenetic relationships of four species of genus Macropodus: M.opercularis,M.chinensis,M.hongkongensis and M.erythropterus.The complete sequences of the mitochondrial Cyt b gene(1 155 bp) of 4 species from 14 individuals were sequenced.Combined these sequences with homologous sequences from GenBank Database,M.opercularis and M.concolor were used as ingroup;Pseudos...
Keywords:Cyt b  RAPD
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