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哺乳动物BMP4蛋白功能位点的进化踪迹分析
引用本文:王瀚,赵淑玲,何九军,杨小录,周峰,侯颖春.哺乳动物BMP4蛋白功能位点的进化踪迹分析[J].动物学杂志,2015,50(1):21-30.
作者姓名:王瀚  赵淑玲  何九军  杨小录  周峰  侯颖春
作者单位:1. 陇南师范高等专科学校生命科学与技术系 陇南742500
2. 中国农业大学农业与生物技术学院 北京 100193
3. 陕西师范大学生命科学学院 西安710062
基金项目:陇南师专2014年重点科研项目(2014LSZK01003);
摘    要:哺乳动物骨形态发生蛋白(BMPs)具有促进动物软骨形成,调节细胞增殖、分化及迁移的多种功能。此外,该蛋白在动物个体发育及人(Homo sapiens)肿瘤的发生、发展过程中也扮演着重要角色。本文以人源骨形态发生蛋白4(BMP4)为种子序列,利用多种生物信息学工具进行哺乳动物BMP4蛋白的序列查找及其同源蛋白的搜索,共得到具有完整结构域的同源蛋白序列72条,并以此为基础对哺乳动物BMP4的进化踪迹位点及相关的功能位点进行比较研究。结果表明,BMP4蛋白家族的TGFβ-propeptide结构域具22个全家族保守残基,而TGF-β结构域仅具84个亚家族特异性残基。人BMP4蛋白TGF-β结构域的配基结合位点主要分布于结合口袋的边缘区域。本研究可为BMP4蛋白重要功能区残基的确定及未知功能位点的预测提供信息。

关 键 词:骨形态发生蛋白4  进化踪迹分析  配基结合口袋
收稿时间:5/7/2014 12:00:00 AM
修稿时间:2014/12/17 0:00:00

Evolutionary Trace Analysis of Functional Sites of the BMP4 Family
WANG Han,ZHAO Shu-Ling,HE Jiu-Jun,YANG Xiao-Lu,ZHOU Feng and HOU Ying-Chun.Evolutionary Trace Analysis of Functional Sites of the BMP4 Family[J].Chinese Journal of Zoology,2015,50(1):21-30.
Authors:WANG Han  ZHAO Shu-Ling  HE Jiu-Jun  YANG Xiao-Lu  ZHOU Feng and HOU Ying-Chun
Abstract:
Keywords:BMP4  evolutionary trace analysis  ligand-binding pockets
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