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| 利用18S和ITS序列揭示8种鲇形目鱼类的系统发育 | |
| 引用本文： | 杨光,俞菊华,徐跑,唐永凯,李建林,李红霞,卢中华,阮瑞霞.利用18S和ITS序列揭示8种鲇形目鱼类的系统发育[J].动物学杂志,2010,45(4):110-117. |
| 作者姓名： | 杨光 俞菊华 徐跑 唐永凯 李建林 李红霞 卢中华 阮瑞霞 |
| 作者单位： | 1. 上海海洋大学水产与生命学院,上海,201306 2. 中国水产科学研究院淡水渔业研究中心农业部水生动物遗传育种和养殖生物学重点开放实验室,无锡,214081 3. 上海海洋大学水产与生命学院,上海,201306;中国水产科学研究院淡水渔业研究中心农业部水生动物遗传育种和养殖生物学重点开放实验室,无锡,214081;南京农业大学无锡渔业学院,无锡,214081 4. 南京农业大学无锡渔业学院,无锡,214081 |
| 基金项目： | 国家科技基础条件平台项目，农业部淡水鱼类遗传育种和养殖生物学重点开放实验室开放基金项目 |
| 摘 要： | 为了探讨鲇形目(Siluriformes)鱼类系统发育关系,本研究克隆了黄颡鱼(Pelteobagrus fulvidraco)、长吻(Leiocassis longirostris)、斑鳠(Mystus guttatus)、革胡子鲇(Clarias gariepinus)、鲇鱼(Silurus asotus)和斑点叉尾(Ictalurus punctatus)6种鱼类的18S和两个内转录间隔区(包括全长ITS1-5.8S-ITS2)基因,结合GenBank中双须缺鳍鲇(Kryptopterus bicirrhis)和脂鳍胡鲇(Dinotopterus cunningtoni)的同源序列进行比较分析,结果表明,(1)8种鱼18S的长度为1814～1842bp,同源性达97%以上,5.8S均为157bp,同源性也高达99.36%～100%;(2)8种鱼ITS1长度为335～620bp,其中,黄颡鱼的最长,为618～620bp,斑点叉尾的最短,为335～336bp;ITS2长度为265～459bp,其中,脂鳍胡鲇最长,为459bp,斑点叉尾的最短,约为270bp。ITS1序列的同源性为29.45%～88.21%,其中,革胡子鲇和脂鳍胡鲇同源性最高,鲇鱼和革胡子鲇同源性最低。ITS2序列的同源性为41.59%～94.07%,其中,革胡子鲇和脂鳍胡鲇同源性最高,鲇鱼和革胡子鲇同源性最低;(3)分别以鲤鱼(Cyprinus carpio)18S和ITS为外群,采用NJ法构建18S、ITS系统发育树,结果显示,鲇科与胡鲇科的关系最近,鲿科与这两科关系较远,科与另外3科关系最远。鲿科中属和黄颡鱼属的关系较鳠属更近;胡鲇科的胡鲇属和脂鳍胡鲇属是关系很近的两个属;鲇科的鲇属和缺鳍鲇属是关系较远的两属。 |
| 关 键 词： | 鲇形目 系统发育 |
| 收稿时间： | 2009/11/18 0:00:00 |
| 修稿时间： | 2010/4/23 0:00:00 |
Phylogenetic Relationship among 8 Common Species of Catfish Based on Ribosome 18S and ITS Sequences |
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| YANG Guang,YU Ju-Hu,XU Pao,TANG Yong-Kai,LI Jian-Lin,LI Hong-Xi,LU Zhong-Hua and RUAN Rui-Xia.Phylogenetic Relationship among 8 Common Species of Catfish Based on Ribosome 18S and ITS Sequences[J].Chinese Journal of Zoology,2010,45(4):110-117. | |
| Authors: | YANG Guang YU Ju-Hu XU Pao TANG Yong-Kai LI Jian-Lin LI Hong-Xi LU Zhong-Hua and RUAN Rui-Xia |
| Institution: | College of Fisheries and Life Science,Shanghai Ocean University,Shanghai 201306;Key Laboratory of Genetic Breeding and Aquaculture Biology of Freshwater Fishes,Ministry of Agriculture, Freshwater Fisheries Research Center,Chinese Academy of Fishery Science,Wuxi 214081;College of Fisheries and Life Science,Shanghai Ocean University,Shanghai 201306; Key Laboratory of Genetic Breeding and Aquaculture Biology of Freshwater Fishes,Ministry of Agriculture, Freshwater Fisheries Research Center,Chinese Academy of Fishery Science,Wuxi 214081; Wuxi Fishery College,Nanjing Agricultural University,Wuxi 214081,China;Key Laboratory of Genetic Breeding and Aquaculture Biology of Freshwater Fishes,Ministry of Agriculture, Freshwater Fisheries Research Center,Chinese Academy of Fishery Science,Wuxi 214081;Key Laboratory of Genetic Breeding and Aquaculture Biology of Freshwater Fishes,Ministry of Agriculture, Freshwater Fisheries Research Center,Chinese Academy of Fishery Science,Wuxi 214081;Key Laboratory of Genetic Breeding and Aquaculture Biology of Freshwater Fishes,Ministry of Agriculture, Freshwater Fisheries Research Center,Chinese Academy of Fishery Science,Wuxi 214081;Wuxi Fishery College,Nanjing Agricultural University,Wuxi 214081,China;Wuxi Fishery College,Nanjing Agricultural University,Wuxi 214081,China |
| Abstract: | |
| Keywords: | 18S ITS |
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