肠道气泡堆积对银鲳肠道菌群结构的影响 |
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引用本文: | 郑迪,王倩,王磊,施兆鸿,彭士明.肠道气泡堆积对银鲳肠道菌群结构的影响[J].动物学杂志,2020,55(2):247-255. |
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作者姓名: | 郑迪 王倩 王磊 施兆鸿 彭士明 |
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作者单位: | 中国水产科学研究院东海水产研究所 农业农村部东海渔业资源开发利用重点实验室 上海 200090; 上海海洋大学水产与生命学院 上海 201306,中国水产科学研究院东海水产研究所 农业农村部东海渔业资源开发利用重点实验室 上海 200090,中国水产科学研究院东海水产研究所 农业农村部东海渔业资源开发利用重点实验室 上海 200090,中国水产科学研究院东海水产研究所 农业农村部东海渔业资源开发利用重点实验室 上海 200090,中国水产科学研究院东海水产研究所 农业农村部东海渔业资源开发利用重点实验室 上海 200090 |
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基金项目: | 现代农业(海水鱼)产业技术体系专项资金(No. CARS-47-G25),中央级公益性科研院所基本科研业务费(No. 2420-2019) |
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摘 要: | 为研究肠道气泡堆积对银鲳(Pampus argenteus)肠道菌群的影响,2019年3月于东海水产研究所福鼎研究中心采集了15尾肠道气泡堆积的银鲳为病鱼组,15尾健康银鲳为健康鱼组,并通过16S r DNA基因DNA高通量测序技术结合LEfSe分析方法,对两组样品间菌群结构和多样性进行对比分析。结果显示,病鱼组肠道菌群多样性与健康鱼组无显著差异(P 0.05),但病鱼组肠道菌群的均匀度和相对丰度都显著低于健康鱼组(P 0.05)。两组样品的优势菌群均为变形菌门(Proteobacteria),且相对丰度都较大(超过97%)。此外,利用LEfSe分析两组样品发现,病鱼组中如根瘤菌(Rhizobium)、栖热菌(Thermus)等好氧菌丰度显著高于健康鱼组,而不动肝菌(Acinetobacter)、微酸菌(Ilumatobacter)等显著低于健康鱼组,蓝细菌(Cyanobacteria)相对丰度显著高于健康鱼组。由此可以表明,肠道气泡堆积很可能会引发肠道菌群紊乱。
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关 键 词: | 银鲳 气泡堆积 高通量测序 肠道菌群 |
收稿时间: | 2019/10/12 0:00:00 |
修稿时间: | 2020/3/13 0:00:00 |
Effect of the Intestinal Gas Bubble Accumulation on Intestinal Bacterial Communities in Silver Pomfret |
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Abstract: | |
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Keywords: | Pampus argenteus Gas bubble accumulation High-throughput sequencing Intestinal microorganisms |
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