| 不同地理种群鳄蜥tlr4基因遗传多样性及SNPs分布特点分析 |
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| 引用本文： | 莫大颖,江海英,黄铭威,武正军,陈金平.不同地理种群鳄蜥tlr4基因遗传多样性及SNPs分布特点分析[J].动物学杂志,2019,54(6):845-859. |
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| 作者姓名： | 莫大颖 江海英 黄铭威 武正军 陈金平 |
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| 作者单位： | 珍稀濒危动植物生态与环境保护教育部重点实验室 桂林541004;广西濒危动物生态学重点实验室 桂林541004;广东省生物资源应用研究所 广州510260;广东省生物资源应用研究所 广州510260;珍稀濒危动植物生态与环境保护教育部重点实验室 桂林541004;广西濒危动物生态学重点实验室 桂林541004 |
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| 基金项目： | 广州市科技计划项目重点项目专题（No. 201804020080），国家自然科学基金项目（No. 31760623） |
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| 摘 要： | Toll样受体(TLRs)是一类识别病原体中高度保守的病原相关分子模式(PAMPs)的蛋白家族,在启动先天性免疫中具有重要作用。人类toll样受体4基因(toll4)的点突变与许多疾病有关,如呼吸道合胞病毒感染、动脉粥样硬化、疟疾等,并且这种点突变往往具有种族分布特异性。鳄蜥(Shinisaurus crocodilurus)是一种古老的爬行动物,属于国家Ⅰ级保护野生动物,由于其遭受非法捕杀、栖息地破坏等人为干扰,目前数量极其稀少。近年来,鳄蜥因疾病造成大量的死亡,且这种疾病的分布具有种群差异性,不同种群往往疾病症状也不同,可能是因不同的病原体感染引起的。我们设想toll4基因的点突变在鳄蜥种群之间可能具有分布的差异性,以适应不同的当地病原体。因此,本文利用PCR产物直接测序和生物信息学分析法初步探索鳄蜥toll4基因的遗传多样性以及单核苷酸多态性(SNPs)的分布特点,验证该基因的点突变是否具有种群特异性分布特点,以及预测其氨基酸替换是否对蛋白质结构和功能产生影响。结果获得的扩增片段长为1 694 bp,在5个种群52条序列中(登录号MN380726～MN380777),共发现27个突变位点,导致9个氨基酸替换,其中3个氨基酸替换被预测为影响蛋白质的结构和功能。27个点突变中有12个只分布在单个种群,4个分布无种群特异性,即每个种群中均有野生型和突变型,其余11个点突变的突变型分布在2或3个种群不等。研究表明,鳄蜥toll4基因遗传多态性在各种群间不一致,且点突变具有种群特异性分布特征,反映不同地理种群遭受不同的病原压力。
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| 关 键 词： | Toll样受体4 遗传多样性 点突变 鳄蜥 |
| 收稿时间： | 2019/7/4 0:00:00 |
| 修稿时间： | 2019/10/24 0:00:00 |
Genetic Diversity and SNPs Distribution Characteristics of tlr4 Gene in Different Geographic Populations of the Chinese Crocodile Lizard |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Toll-like receptor 4 Genetic diversity Point mutations Shinisaurus crocodilurus |
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