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鲤TRAP分子标记反应体系的建立与优化
引用本文:曲疆奇,苏胜彦,董在杰,明俊超,梁政远,袁新华.鲤TRAP分子标记反应体系的建立与优化[J].动物学杂志,2010,45(3):72-78.
作者姓名:曲疆奇  苏胜彦  董在杰  明俊超  梁政远  袁新华
作者单位:1. 南京农业大学无锡渔业学院,无锡,214081
2. 中国水产科学研究院淡水渔业研究中心农业部淡水鱼类遗传育种和养殖生物学重点开放实验室,无锡,214081
3. 南京农业大学无锡渔业学院,无锡,214081;中国水产科学研究院淡水渔业研究中心农业部淡水鱼类遗传育种和养殖生物学重点开放实验室,无锡,214081
基金项目:现代农业产业技术体系建设专项资金项目,国家"十一五"科技支撑计划项目专题,农业部淡水鱼类遗传育种和养殖生物学重点开放实验室开放课题 
摘    要:针对鲤(Cyprinus carpio)这一主要水产养殖品种设计了靶位区域扩增多态性(target region amplified polymorphism,TRAP)分子标记的反应体系,对影响TRAP反应体系的各参数,包括Mg2+、dNTPs、TaqDNA聚合酶、模板DNA和引物浓度进行了优化,建立了适合鲤的、稳定、可重复的TRAP-PCR反应体系。在15μlPCR反应体系中,Mg2+浓度为1.5mmol/L、dNTPs浓度为0.35mmol/L、两个随机引物浓度均为3pmol/L、固定引物浓度为10pmol/L、含DNA模板60ng、TaqDNA聚合酶1.0U。鲤的TRAP反应程序为:94℃4min,1个循环;94℃45s,35℃45s,72℃1min,5个循环;94℃45s,53℃45s,72℃1min,35个循环;72℃10min,1个循环。这一优化体系的建立为今后进行鲤群体遗传多样性、种质鉴定、遗传连锁图谱及亲缘关系分析等方面的研究提供了新的分子标记。

关 键 词:  TRAP标记  体系  优化
收稿时间:2009/11/3 0:00:00
修稿时间:2009/12/22 0:00:00

Establishment and Optimization of Reaction System for TRAP Markers in Common Carp (Cyprinus carpio)
QU Jiang-Qi,SU Sheng-Yan,DONG Zai-Jie,MING Jun-Chao,LIANG Zheng-Yuan and YUAN Xin-Hua.Establishment and Optimization of Reaction System for TRAP Markers in Common Carp (Cyprinus carpio)[J].Chinese Journal of Zoology,2010,45(3):72-78.
Authors:QU Jiang-Qi  SU Sheng-Yan  DONG Zai-Jie  MING Jun-Chao  LIANG Zheng-Yuan and YUAN Xin-Hua
Institution:QU Jiang-Qi SU Sheng-Yan DONG Zai-Jie* MING Jun-Chao LIANG Zheng-Yuan YUAN Xin-Hua ( Wuxi Fisheries College,Nanjing Agricultural University,Wuxi 214081, Key Open Laboratory of Genetic Breeding , Aquaculture Biology of Freshwater Fishes,Ministry of Agriculture,Freshwater Fisheries Research Center,Chinese Academy of Fishery Sciences,China)
Abstract:
Keywords:Common Carp (Cyprinus carpio)  TRAP markers  System  Optimization  
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