暗纹东方鲀线粒体COⅡ及两侧tRNA基因的克隆和序列分析 |
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引用本文: | 邵爱华,朱江,陈葵,史全良,李新平,沈颂东.暗纹东方鲀线粒体COⅡ及两侧tRNA基因的克隆和序列分析[J].动物学杂志,2005,40(6):1-8. |
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作者姓名: | 邵爱华 朱江 陈葵 史全良 李新平 沈颂东 |
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作者单位: | 苏州大学生命科学学院,苏州,215123;苏州科技学院生物学系,苏州,215009;苏州大学生命科学学院,苏州,215123 |
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基金项目: | 农业部行业标准资助项目(No.2004-04084) |
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摘 要: | 用细胞色素氧化酶第二亚基基因(COⅡ)特异性引物对暗纹东方(Takifugu fasciatus)的线粒体DNA(mtDNA)进行PCR扩增,克隆并测定了COⅡ及其侧翼tRNA基因的全序列,结果显示,COⅡ基因691 bp和5′端上游的tRNAAsn基因及3′端下游的tRNALys基因序列共890 bp。用DNA分析软件比较暗纹东方与GenBank中9个目11种鱼类的COⅡ序列,显示暗纹东方与这些鱼类的COⅡ基因具有较高的同源性;其中与同属红鳍东方(T.rubripes)的同源性最高为99.0%。暗纹东方COⅡ基因的核苷酸组成中,A T含量为56%,与其他11种鱼类的A T含量(55%~62%)相近。鱼类COⅡ序列组成对A T核苷酸的偏倚程度比较低。根据暗纹东方与其他11种鱼的COⅡ基因序列同源性所建立的分子进化树,与传统的分类地位基本吻合。推定的tRNA二级结构为典型的三叶草型结构。
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关 键 词: | 暗纹东方鲀 线粒体DNA 细胞色素氧化酶第二亚基 系统学 |
文章编号: | 0250-3263(2005)06-01-08 |
收稿时间: | 2005-04-05 |
修稿时间: | 2005-09-08 |
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