用mtDNA控制区序列鉴定长须鲸标本 |
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引用本文: | 朱小静,何鑫,向余劲攻,宋晨薇,单鹍,刘文亮. 用mtDNA控制区序列鉴定长须鲸标本[J]. 动物学杂志, 2018, 53(2): 234-242 |
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作者姓名: | 朱小静 何鑫 向余劲攻 宋晨薇 单鹍 刘文亮 |
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作者单位: | 华东师范大学生态与环境科学学院,上海科技馆分馆上海自然博物馆自然史研究中心,崇明生态研究院,华东师范大学生态与环境科学学院,上海科技馆分馆上海自然博物馆自然史研究中心,华东师范大学生态与环境科学学院 |
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基金项目: | 河口海岸学国家重点实验室科研业务费(No. SKLEC-2017TASK07) |
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摘 要: | 测定了采自长江口和杭州湾交汇海域的一头死亡大型须鲸骨骼标本的线粒体DNA(mt DNA)控制区序列(Control region)976 bp(登录号MF781125)、细胞色素C氧化酶Ⅰ基因(COⅠ)序列642 bp(登录号MG010134)和Cyt b序列307 bp(登录号MG010133)。通过与Gen Bank已发表的同源序列blast结果表明,与美国加利福尼亚海域长须鲸(Balaenoptera physalus)的控制区序列相似度达99%,仅在756 bp处有一个碱基T和C转换的差异;基于HKG+G模型,使用UPGMA聚类分析法和最大似然法(ML)构建的系统发育树与blast结果一致,故将标本鉴定为长须鲸,推测该个体来源于北太平洋。获取的细胞色素C氧化酶Ⅰ和Cyt b序列存在多个终止密码子,无法获取同源性较高的序列,推断可能为线粒体假基因。
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关 键 词: | mtDNA;长须鲸;鉴定;线粒体假基因 |
收稿时间: | 2017-10-01 |
修稿时间: | 2018-03-10 |
Identification of a Balaenoptera physalus Specimen by Using Mitochondrial DNA Sequences |
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Affiliation: | Institute of Eco-Chongming (IEC) |
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Abstract: | |
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Keywords: | mtDNA Balaenoptera physalus Identification Nuclear mitochondrial pseudogene |
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