| 克氏光唇鱼线粒体基因组测定及光唇鱼属的系统发育分析 |
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| 引用本文： | 杨杨,宋小晶,唐文乔,张亚.克氏光唇鱼线粒体基因组测定及光唇鱼属的系统发育分析[J].动物学杂志,2018,53(2):207-219. |
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| 作者姓名： | 杨杨 宋小晶 唐文乔 张亚 |
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| 作者单位： | 海洋动物系统分类与进化上海高校重点实验室,海洋动物系统分类与进化上海高校重点实验室,海洋动物系统分类与进化上海高校重点实验室,海洋动物系统分类与进化上海高校重点实验室 |
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| 基金项目： | 国家科技基础性工作专项（No. 2015FY110200） |
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| 摘 要： | 根据侧条光唇鱼(Acrossocheilus parallens)线粒体基因(mt DNA)序列设计引物,采用引物步移和PCR扩增产物测序,获得了克氏光唇鱼(A.kreyenbergii)的mt DNA全序列。结构分析表明,克氏光唇鱼mt DNA为首尾闭合的环状基因,全长16 596 bp,编码37个基因,包括13个蛋白编码基因、22个t RNA基因、2个r RNA基因和两段非编码区(D-loop和轻链复制起点OL),碱基组成具有明显的A+T偏好和反G偏倚现象。13个蛋白编码基因中,除COⅠ的起始密码子是GTG,其余基因的起始密码子均为ATG;终止密码子包括完全的终止密码子TAA(38.46%)和TAG(7.69%),不完全的终止密码子TA(15.38%)和T(38.46%)。在D-loop区的811~837 bp区间发现了一段"TA"短串联重复序列。从蛋白编码基因所包含的信息量、变异位点和变异率看,ND5、ND4、COⅠ和ND2最适合作为光唇鱼属种间系统发育分析的分子标记。采用贝叶斯法利用13个蛋白编码基因所构建的系统发育树显示,光唇鱼属和白甲鱼属(Onychostoma)的24种鱼类各自没有聚为单系群,相互间不能明确区分。
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| 关 键 词： | 克氏光唇鱼 线粒体基因组 系统发育 光唇鱼属 |
| 收稿时间： | 2017/7/19 0:00:00 |
| 修稿时间： | 2018/3/2 0:00:00 |
Complete Mitochondrial Genome of Acrossocheilus kreyenbergii, with Phylogenetic Analysis of Genus Acrossocheilus |
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| YANG Yang,TANG Wen-Qiao.Complete Mitochondrial Genome of Acrossocheilus kreyenbergii, with Phylogenetic Analysis of Genus Acrossocheilus[J].Chinese Journal of Zoology,2018,53(2):207-219. |
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| Authors: | YANG Yang TANG Wen-Qiao |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Acrossocheilus kreyenbergii Mitochondrial genome Phylogenetic analysis Acrossocheilus |
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