| 鲤IGF2b基因5'侧翼区序列克隆及不同鲤该区域GC富集区的甲基化分析 |
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| 引用本文： | 张成锋,苏胜彦,朱健,朱文彬,刘珊,董在杰.鲤IGF2b基因5''侧翼区序列克隆及不同鲤该区域GC富集区的甲基化分析[J].动物学杂志,2012,47(2):98-104. |
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| 作者姓名： | 张成锋 苏胜彦 朱健 朱文彬 刘珊 董在杰 |
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| 作者单位： | 中国水产科学研究院淡水渔业研究中心 农业部淡水渔业和种质资源利用重点实验室 无锡 214081; 南京农业大学无锡渔业学院 无锡 214081;中国水产科学研究院淡水渔业研究中心 农业部淡水渔业和种质资源利用重点实验室 无锡 214081; 南京农业大学无锡渔业学院 无锡 214081;中国水产科学研究院淡水渔业研究中心 农业部淡水渔业和种质资源利用重点实验室 无锡 214081; 南京农业大学无锡渔业学院 无锡 214081;中国水产科学研究院淡水渔业研究中心 农业部淡水渔业和种质资源利用重点实验室 无锡 214081; 南京农业大学无锡渔业学院 无锡 214081;南京农业大学无锡渔业学院 无锡 214081;中国水产科学研究院淡水渔业研究中心 农业部淡水渔业和种质资源利用重点实验室 无锡 214081; 南京农业大学无锡渔业学院 无锡 214081; 南京农业大学动物科技学院 南京 210095 |
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| 基金项目： | 现代农业产业技术体系建设专项资金项目(No.CARS-46),中央级公益性科研院所基本科研业务费专项资金项目(No.2009JBFB01),江苏省自然基金项目(No.BK2010146); |
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| 摘 要： | 鲤(Cyprinus carpio)胰岛素样生长因子2b(insulin-like growth factor 2b,IGF2b)基因为鲤IGF基因家族重要的成员,已有的研究表明5'侧翼区序列对其功能的发挥有重要作用。因此,采用基因组步移法获取5'侧翼区序列,通过亚硫酸盐修饰的方法分析不同品种该区域GC富集区的甲基化状况。本文成功从鲤基因组DNA中获得695 bp的IGF2b 5'侧翼区序列。已获取的IGF2b 5'侧翼区序列经过TFSEARCH分析后发现了多个转录因子结合位点和TATA框,通过BLAST比对发现,鲤IGF2b 5'侧翼区DNA序列与斑马鱼(Danio rerio)IGF2b基因相比,相似性为87%。检测该区域富含GC的序列17个位点,发现建鲤(C.c.var.jian)有2个个体的3个位点出现甲基化,而黄河鲤(C.c.haematopterus)只有1个个体1个位点出现甲基化,这说明2个品种鲤在这个区域出现甲基化修饰的几率低,也验证了这2品种在该基因该区域GC富集区是稳定的。
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| 关 键 词： | 鲤 IGFb '侧翼区 甲基化 |
| 收稿时间： | 2011/9/19 0:00:00 |
| 修稿时间： | 1/4/2012 12:00:00 AM |
Cloning of IGF2b 5′Flanking Region and Methylation Analysis of Its GC-rich Sequence in Common Carp(Cyprinus carpio) |
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| ZHANG Cheng-Feng,SU Sheng-Yan,ZHU Jian,ZHU Wen-Bin,LIU Shan and DONG Zai-Jie.Cloning of IGF2b 5′Flanking Region and Methylation Analysis of Its GC-rich Sequence in Common Carp(Cyprinus carpio)[J].Chinese Journal of Zoology,2012,47(2):98-104. |
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| Authors: | ZHANG Cheng-Feng SU Sheng-Yan ZHU Jian ZHU Wen-Bin LIU Shan and DONG Zai-Jie |
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| Institution: | Key Laboratory of Freshwater Fisheries and Germplasm Reources Utilization, Ministry of Agriculture, Freshwater Fisheries Research Center, Chinese Academy of Fishery Sciences, Wuxi 214081; Wuxi Fisheries College, Nanjing Agricultural University, Wuxi 214081;Key Laboratory of Freshwater Fisheries and Germplasm Reources Utilization, Ministry of Agriculture, Freshwater Fisheries Research Center, Chinese Academy of Fishery Sciences, Wuxi 214081; Wuxi Fisheries College, Nanjing Agricultural University, Wuxi 214081;Key Laboratory of Freshwater Fisheries and Germplasm Reources Utilization, Ministry of Agriculture, Freshwater Fisheries Research Center, Chinese Academy of Fishery Sciences, Wuxi 214081; Wuxi Fisheries College, Nanjing Agricultural University, Wuxi 214081;Key Laboratory of Freshwater Fisheries and Germplasm Reources Utilization, Ministry of Agriculture, Freshwater Fisheries Research Center, Chinese Academy of Fishery Sciences, Wuxi 214081; Wuxi Fisheries College, Nanjing Agricultural University, Wuxi 214081;Wuxi Fisheries College, Nanjing Agricultural University, Wuxi 214081;Key Laboratory of Freshwater Fisheries and Germplasm Reources Utilization, Ministry of Agriculture, Freshwater Fisheries Research Center, Chinese Academy of Fishery Sciences, Wuxi 214081; Wuxi Fisheries College, Nanjing Agricultural University, Wuxi 214081; College of Animal Science and Technology, Nanjing Agricultural University, Nanjing 210095, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Common Carp(Cyprinus carpio) IGF2b 5′ flanking region Methylation |
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