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长江口邻近水域刀鲚的线粒体控制区序列变异与遗传多样性
引用本文:杨金权,胡雪莲,唐文乔,林弘都.长江口邻近水域刀鲚的线粒体控制区序列变异与遗传多样性[J].动物学杂志,2008,43(1):8-15.
作者姓名:杨金权  胡雪莲  唐文乔  林弘都
作者单位:1. 上海水产大学省部共建种质资源发掘与利用教育部重点实验室,上海,200090
2. 上海水产大学省部共建种质资源发掘与利用教育部重点实验室,上海,200090;上海市质量监督检验技术研究院,上海,200233
3. 成功大学生命科学研究所,台湾,701
基金项目:上海市科学技术委员会重大计划项目(No.04DZ19306),上海市农业委员会攻关项目[2003(1-4)],上海市重点学科建设项目(Y1101)
摘    要:经克隆测序获得了采自长江口九段沙、钱塘江口、舟山等3个地点35尾刀鲚(Coilia nasus)的mtDNA控制区全序列,分析了控制区序列的变异和遗传结构。结果显示,长江口邻近水域刀鲚的mtDNA控制区序列具有长度多态性,全长为1214~1291bp,主要是在第358位点处有以"CTA TGT ATT ATA TTA CAT ATA TTA TGG TAT AGT ACA TA"38bp为单位的1~2次片段重复。种群遗传结构分析显示,长江口邻近水域刀鲚的平均单倍型多样性(h)为0.9983,3个群体的平均核苷酸多样性(π)为0.0262,表现出丰富的遗传多样性和较高的进化潜力。3个刀鲚群体间的分化指数FST仅为0.012~0.053,而基因交流值Nm却达9.90~40.62。群体间K2-P遗传距离与AMOVA分析结果也表明,长江口及毗邻地区的刀鲚没有发生地理分化。以线粒体DNA控制区全序列构建的NJ树揭示,3个群体的个体组成了2个谱系,但这2个谱系与地理分群并不相关。依据分子钟理论,推测这两个谱系的分化发生在更新世末期。

关 键 词:刀鲚  线粒体控制区  遗传多样性  长江口
文章编号:0250-3263(2008)01-08-08
收稿时间:2007-06-11
修稿时间:2007-11-07

mtDNA Control Region Sequence Variation and Genetic Diversity of Coilia nasus in Yangtze River Estuary and Its Adjacent Waters
YANG Jin-Quan,HU Xue-Lian,TANG Wen-Qiao and LIN Hung-Du.mtDNA Control Region Sequence Variation and Genetic Diversity of Coilia nasus in Yangtze River Estuary and Its Adjacent Waters[J].Chinese Journal of Zoology,2008,43(1):8-15.
Authors:YANG Jin-Quan  HU Xue-Lian  TANG Wen-Qiao and LIN Hung-Du
Institution:Key Laboratory of Exploration and Utilization of Aquatic Genetic Resources,Shanghai Fisheries University,Ministry of Education,Shanghai 200090;Key Laboratory of Exploration and Utilization of Aquatic Genetic Resources,Shanghai Fisheries University,Ministry of Education,Shanghai 200090; Shanghai Institute of Quality Inspection and Technical Research,Shanghai 200233;Key Laboratory of Exploration and Utilization of Aquatic Genetic Resources,Shanghai Fisheries University,Ministry of Education,Shanghai 200090;Department of Life Sciences,Cheng-Kung University,Taiwan 701,China
Abstract:
Keywords:Coilia nasus  mtDNA control region  Genetic diversity  Yangtze River estuary
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