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三种海豚线粒体COI基因的序列分析
引用本文:李莉好,喻达辉,黄桂菊,郭奕惠,梁沛文,江世贵,贾晓平.三种海豚线粒体COI基因的序列分析[J].动物学杂志,2007,42(3):20-27.
作者姓名:李莉好  喻达辉  黄桂菊  郭奕惠  梁沛文  江世贵  贾晓平
作者单位:1. 中国水产科学研究院南海水产研究所,广州,510300;上海水产大学,上海,200090
2. 中国水产科学研究院南海水产研究所,广州,510300
基金项目:中国水产科学研究院水产种质资源与养殖技术重点实验室基金(0501)资助
摘    要:对瓶鼻海豚(Tursiops truncatus)、中华白海豚(Sousa chinensis)和糙齿海豚(Steno bredanensis)的线粒体DNA COI基因进行了测序分析。PCR产物约700bp。扩增产物直接测序,去除引物序列后分别获得643、618和618bp的核苷酸序列。碱基组成平均为,T:31·07%,C:26·13%,A:27·27%,G:15·50%,GC含量为41·63%,其中碱基G的含量明显较低。与Gen Bank中9种鲸的同源序列比对,去除部分端部序列后得到597个比对位点,包括141个简约信息位点,43个单突变子,无插入/缺失位点。12种鲸的种间序列差异较大,其序列变异度在2·1%~17·1%之间。597个比对位点编码199个氨基酸,其中有9个氨基酸发生改变,其中一个氨基酸突变可将齿鲸亚目和须鲸亚目分开。NJ系统树表明,海豚科形成单系类群,瓶鼻海豚和中华白海豚的亲缘关系较近。上述分析表明,COI基因可用于鲸类的种类鉴定和系统发育分析。

关 键 词:海豚  COI基因  序列分析
文章编号:0250-3263(2007)03-20-08
修稿时间:2006-09-11

Sequence Analysis of Mitochondrial COI Gene in Three Dolphin Species
LI Li-Hao,YU Da-Hui,HUANG Gui-Ju,GUO Yi-Hui,LIANG Pei-Wen,JIANG Shi-Gui,JIA Xiao-Ping.Sequence Analysis of Mitochondrial COI Gene in Three Dolphin Species[J].Chinese Journal of Zoology,2007,42(3):20-27.
Authors:LI Li-Hao  YU Da-Hui  HUANG Gui-Ju  GUO Yi-Hui  LIANG Pei-Wen  JIANG Shi-Gui  JIA Xiao-Ping
Institution:1. South China Sea Fisheries Research Institute, Chinese Academy of Fishery Sciences, Guangzhou 2. Shanghai Fisheries University, Shanghai 200090, China
Abstract:
Keywords:Dolphin  COI gene  Sequence analysis
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