圈养小熊猫粪便微生物组成 及其影响因子初探

小熊猫（Ailurus fulgens）经过长期的适应性进化，食性依赖于高纤维含量的竹子，同时保留了具有食肉动物特征的消化系统，在分类学、系统进化及生态学领域都具有重要的研究价值。本研究旨在分析小熊猫粪便微生物结构组成，探讨其食竹习性的生物学机制。采集上海动物园和杭州动物园两种日粮的小熊猫新鲜粪便，开展基于16S rRNA基因的Hiseq高通量测序，分析小熊猫粪便微生物的结构组成，并探讨日粮组成和年龄（幼龄组2只，成年组4只，老年组3只）对小熊猫粪便微生物结构组成的影响。研究表明，不同日粮组成会影响小熊猫粪便微生物多样性（P < 0.05），成年组小熊猫粪便微生物多样性显著高于幼龄组和老年组（P < 0.05）。在微生物门水平上，小熊猫粪便微生物以厚壁菌门（Firmicutes）、变形菌门（Proteobacteria）和拟杆菌门（Bacteroidetes）为主，在属水平上以埃希-志贺菌属（Escherichia-Shigella）、狭义梭菌属（Clostridium sensu stricto）和肠杆菌属（Enterobacter）为主。小熊猫粪便微生物中，具有代谢碳水化合物和氨基酸功能的基因丰度最高，其次为代谢能量和脂类的基因。与纤维素降解有关的酶中，能够表达6-磷酸-β-葡糖苷酶和β-葡糖苷酶的基因丰度最高，有助于小熊猫消化高纤维性食物。小熊猫的肠道微生物具有很强的代谢碳水化合物和氨基酸的功能，并且能够产生高丰度消化纤维素的酶。

Fecal Microbial Composition and Influencing Factors of Captive Red Panda Ailurus fulgens