长江中下游褶纹冠蚌10个群体COⅠ基因序列变异分析 |
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引用本文: | 贾名静,李家乐,牛东红,白志毅.长江中下游褶纹冠蚌10个群体COⅠ基因序列变异分析[J].动物学杂志,2009,44(1):1-8. |
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作者姓名: | 贾名静 李家乐 牛东红 白志毅 |
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作者单位: | 上海海洋大学省部共建水产种质资源挖掘与利用教育部重点实验室; |
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基金项目: | 国家科技支撑计划课题(No.2006BAD01A13);;农业部农业结构调整重大技术研究专项项目(No.06-05-05B);;上海市科委基础重大项目(No.06DJ14003);;上海市水产养殖重点学科建设项目(Y1101) |
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摘 要: | 以线粒体COⅠ基因为分子标记,对长江中下游褶纹冠蚌(Cristaria plicata)10个群体共200个个体的遗传多样性进行了研究。获得了620bp的同源序列,A+T的平均含量为60.1%,明显高于G+C含量(39.9%),有105个核苷酸变异位点,占全部碱基数的17%,转换和颠换之比达到8.7,检测到了58个单倍型(GenBank登录号:EU698893~EU698950),Hap-5是主体单倍型,占总个体数的41%。褶纹冠蚌鄱阳湖群体(PY)平均核苷酸差异数和核苷酸多样性指数均最高,分别为25.426和0.04101,太湖群体(TH)和衢州群体(QZ)遗传多样性参数较低。基于群体间遗传距离构建的NJ系统树中,洪泽湖内的3个群体与巢湖群体首先聚为一支,然后与由钱塘江群体、太湖群体、衢州群体和洪湖群体聚成的分支聚在一起,而后与洞庭湖群体聚在一起,最外侧一支为鄱阳湖群体。分子方差分析(AMOVA)得出群体间的遗传分化指数(Fst)为0.2081(P<0.001),说明我国褶纹冠蚌不同群体间存在一定的遗传分化。
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关 键 词: | 褶纹冠蚌 COⅠ基因 长江中下游 遗传多样性 鄱阳湖 |
收稿时间: | 7/3/2008 12:00:00 AM |
修稿时间: | 2008/11/5 0:00:00 |
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