| 根据cpDNA trnL-F非编码区序列变异分析黑桫椤海南和广东种群的遗传结构与系统地理 |
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| 引用本文： | 苏应娟,王艇,郑博,江宇,欧阳蒲月,陈国培,王伯荪.根据cpDNA trnL-F非编码区序列变异分析黑桫椤海南和广东种群的遗传结构与系统地理[J].生态学报,2004,24(5):914-919. |
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| 作者姓名： | 苏应娟 王艇 郑博 江宇 欧阳蒲月 陈国培 王伯荪 |
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| 作者单位： | 中山大学生命科学学院,广州,510275 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金资助项目 ( 3 0 170 10 1)，国家自然科学基金重点资助项目 ( 3 983 0 3 10 )，广东省自然科学基金资助项目 ( 0 1112 5 )~~ |
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| 摘 要： | 以黑桫椤分布在海南和广东 9个种群为材料 ,通过 PCR产物直接测序和克隆后再测序的方法测定了叶绿体 DNA(cp DNA) trn L- F非编码区序列。序列长度介于 10 17bp至 10 2 1bp;碱基组成 A T含量较高 ,百分比值为 6 0 .4 3%～ 6 2 .2 6 %。根据序列的核苷酸变异共鉴定出 15个单倍型。黑桫椤具高水平单倍型多样性 (h=0 .880 )和较高水平核苷酸多样性 (Dij=0 .0 0 342 ) ,其悠长的进化历史可能增加了遗传变异在谱系内的积累。单倍型最小生成网图和邻接树、种群间分化度 (FST=0 .12 6 4 5 )和基因流 (N m=3.4 9)、AMOVA分析 (地区间遗传变异占 11.91% ,p>0 .0 5 )以及 DNA歧义度结果一致显示 ,黑桫椤分布在海南和广东的种群彼此间不存在遗传分化。黑桫椤单倍型的系统发育地理式样具“星状”特征 ,提示种群在历史上曾经发生过扩张 ,扩张后的种群还未能获得足够时间去建立更加复杂的结构
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| 关 键 词： | 黑桫椤 cpDNAtrnL-F非编码区 单倍型 遗传结构 地理分化 |
| 文章编号： | 1000-0933(2004)05-0914-06 |
| 收稿时间： | 9/8/2003 12:00:00 AM |
| 修稿时间： | 2003/12/28 0:00:00 |
Genetic structure and phylogeography of populations of Alsophila podophylla in Hainan and Guangdong, southern China, based on cpDNA trnL-F noncoding sequences |
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| SU Yingjuan,WANG Ting,ZHENG Bo,JIANG Yu,OUYANG Puyue,CHEN Gupei and WANG Bosun.Genetic structure and phylogeography of populations of Alsophila podophylla in Hainan and Guangdong, southern China, based on cpDNA trnL-F noncoding sequences[J].Acta Ecologica Sinica,2004,24(5):914-919. |
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| Authors: | SU Yingjuan WANG Ting ZHENG Bo JIANG Yu OUYANG Puyue CHEN Gupei and WANG Bosun |
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| Institution: | School of Life Sciences; Sun Yat-sen University; Guangzhou; China |
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| Abstract: | Alsophila podophylla Hook is a large perennial herbaceous fern species belonging to family Cyatheaceae in taxonomy. In this research, population genetic structure and phylogeographical pattern of the species were inferred from variations of chloroplast DNA (cpDNA) trnL-F noncoding sequences. 9 natural populations were sampled, locating at Jian Feng Ling (HNJFL), Wu Zhi Shan (HNWZS), and Diao Luo Shan (HNDLS) in Hainan Province, as well as Gui Keng (ZQDHG), Ji Feng Lin (ZQDHJ), Da Chong (FKHDC), Du Tian (FKH... |
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| Keywords: | Alsophila podophylla cpDNA trnL-F noncoding sequence haplotype genetic structure geographical differentiation |
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