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| 蒙古狼线粒体基因组序列分析及其系统发育地位 | |
| 引用本文： | 陈磊,张洪海,马建章.蒙古狼线粒体基因组序列分析及其系统发育地位[J].生态学报,2010,30(6):1463-1471. |
| 作者姓名： | 陈磊 张洪海 马建章 |
| 作者单位： | 1. 东北林业大学野生动物资源学院,哈尔滨,150040;曲阜师范大学生命科学学院,曲阜,273165 2. 曲阜师范大学生命科学学院,曲阜,273165 3. 东北林业大学野生动物资源学院,哈尔滨,150040 |
| 基金项目： | 教育部2007年新世纪优秀人才支持计划资助项目（NCET-07-0507）;山东省自然科学基金重点资助项目(Z2008D01);山东省中青年科学家奖励基金资助项目(2005BS02005);山东省科技攻关计划资助项目(2007GG2009011) |
| 摘 要： | 应用Long-PCR和克隆测序法得到蒙古狼(Canis lupus chanco)线粒体基因组全序列,结合GenBank中现有犬科动物线粒体基因组数据,应用最大简约法(MP)、最大似然法(ML)和Bayesian分析法对蒙古狼的系统发育地位进行了探讨。结果如下:蒙古狼线粒体基因组全长16709bp,包含13个蛋白质编码基因、22个tRNA基因、2个rRNA基因和1个非编码区。序列碱基的组成存在明显的A-T偏好性。tRNA基因中除tRNA-Ser(AGY)缺少双氢尿嘧啶(DHU)臂以外,其余均能折叠成典型的三叶草二级结构。大多数蛋白质编码基因的起始和终止密码子与犬科动物有报道相同,COXⅡ基因的起始密码子为ATA,与其他犬科动物不同。基于12S rRNA+16S rRNA+H链上的12个蛋白质编码基因的联合数据的系统发育分析发现,在已报道的狼亚种数据中,西藏狼(Canis lupus laniger)的分化时间最早,其次为阿拉伯狼(Canis lupus arabs),蒙古狼与欧亚狼(Canis lupuslupus)的系统发育地位最为接近。 |
| 关 键 词： | 线粒体 基因组 蒙古狼 系统发育 |
| 收稿时间： | 2009/8/17 0:00:00 |
| 修稿时间： | 2009/12/1 0:00:00 |
The mitochondrial genome of the Mongolian wolf Canis lupus chanco and a phylogenetic analysis of Canis |
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| chenlei,zhanghonghai and.The mitochondrial genome of the Mongolian wolf Canis lupus chanco and a phylogenetic analysis of Canis[J].Acta Ecologica Sinica,2010,30(6):1463-1471. | |
| Authors: | chenlei zhanghonghai and |
| Abstract: | The complete mitochondrial genome sequence of the Mongolian wolf,Canis lupus chanco,was determined by the long and accurate polymerase chain reaction ( L-PCR) based on the PCR fragments of primers. In order to clarify the phylogenetic position of Canis lupus chanco,we constructed the phylogenetic tree based on the concatenated 12S rRNA + 16S rRNA + 12 heavy-strand protein-coding genes of 12 Canidae animals with the genomic data obtained from GenBank. Here are the results:The entire mtDNA sequence is 16709 b... |
| Keywords: | mitochondrial genome Canis lupus chanco phylogenetic relationship |
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