| 金沙江干热河谷区胡枝子（Lespedeza Michx）根瘤菌多样性及其系统发育 |
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| 引用本文： | 彭贤超,张小平,徐开未,黄昌学,K．Lindstrom.金沙江干热河谷区胡枝子（Lespedeza Michx）根瘤菌多样性及其系统发育[J].生态学报,2008,28(11):5469-5481. |
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| 作者姓名： | 彭贤超 张小平 徐开未 黄昌学 K．Lindstrom |
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| 作者单位： | 1. 四川农业大学资源环境学院,雅安,625014
2. Department of Applied Chemistry and Microbiology,University of Helsinki,Helsinki 00014 Findand |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金资助项目(30570062) |
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| 摘 要： | 研究利用数值分类、BOXAIR-PCR指纹图谱、16SrDNA PCR-RFLP、16S rDNA和GSⅡ序列分析等方法,研究了分离自金沙江干热河谷区的86株胡枝子根瘤菌的多样性和系统发育,结果表明金沙江干热河谷区胡枝子根瘤菌蕴涵丰富的生物多样性。通过数值分类,供试未知菌株表现出极大的表型性状多样性,能耐高温（60℃）和低pH（4.0）,在低温（10℃）或者高pH（9.0）条件下生长很差,耐盐性也很差。供试未知菌株的16S rDNA用HaeⅢ、MspⅠ、HinfⅠ和TaqⅠ酶切后具有16种遗传图谱类型,其中10株供试未知菌的16S rDNA遗传图谱类型不同于所选用的已知参比菌株。BOXAIR-PCR的分群结果分散,很多在16S rDNA PCR-RFLP中具有相同遗传类型的菌株也表现较大差异,表明了供试菌株在基因组水平上差异很大。序列分析结果表明,6株代表菌株分布于Rhizobium、Sinorhizobium、Mesorhizobium、Bradyrhizobium4个属,16S rDNA序列与GSⅡ序列分别构建的系统发育树在属水平上基本一致,但16S rDNA序列的同源性比GSⅡ高,6株代表菌株间16S rDNA序列的同源性在87.5%～99.5%之间,GSⅡ序列的同源性在79.4%～89.8%之间;而代表菌株与亲缘关系最近的参比菌株间的16S rDNA序列的同源性为99.9%～100%,GSⅡ的同源性为88.9%～99.6%。
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| 关 键 词： | 数值分类 BOXAIR-PCR 16S rDNA PCR-RFLP GSⅡ基因 序列分析 |
| 收稿时间： | 2007/11/21 0:00:00 |
| 修稿时间： | 2008/8/29 0:00:00 |
Diversity and phylogeny of rhizobial strains isolated from root nodules of Lespedeza Michx in arid-hot valley of Jinsha River |
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| PENG Xian-Chao,ZHANG Xiao-Ping,XU Kai-Wei,HUANG Chang-Xue,K.Lindstrom.Diversity and phylogeny of rhizobial strains isolated from root nodules of Lespedeza Michx in arid-hot valley of Jinsha River[J].Acta Ecologica Sinica,2008,28(11):5469-5481. |
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| Authors: | PENG Xian-Chao ZHANG Xiao-Ping XU Kai-Wei HUANG Chang-Xue KLindstrom |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | BOXAIR-PCR 16S rDNA PCR-RFLP |
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