| 可用于微生物群落分子生态学研究的活性污泥总DNA提取方法研究 |
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| 引用本文： | 高平平,赵立平.可用于微生物群落分子生态学研究的活性污泥总DNA提取方法研究[J].生态学报,2002,22(11):2015-2019. |
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| 作者姓名： | 高平平 赵立平 |
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| 作者单位： | 1. 山西大学生物工程实验室,太原,030006
2. 上海交通大学生命科学技术学院,上海,200240 |
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| 基金项目： | 国家“863”高科技研究发展计划资助项目 (SZ-0 3 -0 1 -0 4,2 0 0 1 AA2 1 41 3 1 ) |
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| 摘 要： | 活性污泥样品经液氮速冻、沸水浴融化、溶菌酶处理和 SDS裂解后 ,99%以上细胞裂解。所提取的 DNA经琼脂糖凝胶电泳检测和荧光法浓度测定 ,其片断大小在 2 0 kb左右 ,产量可达 1 .75 6± 0 .1 mg/g MLSS。样品 ABS2 6 0 nm/ABS2 80 nm的比值为 1 .96± 0 .2。以提取的总 DNA为模板 ,进行细菌核糖体小亚基 1 6Sr DNA基因 V3区和多组分苯酚羟化酶大亚基基因 (Lm PHs)的 PCR扩增 ,均获得成功 ,为活性污泥中微生物群落的分子生态学研究提供了一种简便、可靠的 DNA提取方法。
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| 关 键 词： | 微生物群落 分子生态学研究 活性污泥总DNA 提取方法 环境微生物 |
| 文章编号： | 1000-0933(2002)11-2015-05 |
| 收稿时间： | 2001/11/25 0:00:00 |
| 修稿时间： | 2002/8/18 0:00:00 |
DNA Extraction from Activated Sludge for Molecular Community Analysis |
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| GAO Pingping and ZHAO Liping.DNA Extraction from Activated Sludge for Molecular Community Analysis[J].Acta Ecologica Sinica,2002,22(11):2015-2019. |
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| Authors: | GAO Pingping and ZHAO Liping |
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| Institution: | Shanxi Key Lab. of Biotechnology; Shanxi University; Taiyuan; China |
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| Abstract: | A rapid and less instrument\|dependent protocol for direct extraction of DNA from activated sludge sample was developed. To optimize the cell lysis step, four cell lysis treatments (Freeze\|thaw, lysozyme, SDS , and thermal shock +lysozyme + SDS) were used to disrupt dispersed cells and release DNA. The efficiency of cell lysis was assessed microscopically after each treatment step. The quality and quantity of extracted DNA was determined by using both agarose gel electrophoresis and spectrophotometric meas... |
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| Keywords: | activated sludge DNA extraction PCR amplification |
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