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野牦牛(Bos grunniens mutus)mtDNA D\|Loop区的遗传多样性
引用本文:马志杰,钟金城,韩建林,徐惊涛,窦全林,常怀普.野牦牛(Bos grunniens mutus)mtDNA D\|Loop区的遗传多样性[J].生态学报,2009,29(9):4798-4803.
作者姓名:马志杰  钟金城  韩建林  徐惊涛  窦全林  常怀普
作者单位:1. 青海大学畜牧兽医科学院,西宁,810016
2. 西南民族大学生命科学与技术学院,成都,610041
3. 中国农业科学院-国际家畜研究所畜禽与牧草遗传资源联合实验室北京畜牧兽医研究所,北京,100193
4. 青海大学农牧学院,西宁,810003
5. 西南大学生物技术学院,重庆,400715
基金项目:青海大学中青年科研基金资助项目,国家科技部国际科技合作资助项目 
摘    要:为从分子水平上评价野牦牛(Bos grunniens mutus)的遗传多样性,对6头野牦公牛线粒体DNA D-loop 区全序列进行了克隆和测定(GenBank登录号为:FJ548840~FJ548845),结合GenBank中已刊登的2条野牦牛的相应序列,使用BioEdit 7 0 9、DnaSP 4.10.1、Arlequin 3.11等生物信息学软件,对全部8条序列开展了比对分析,确定了多态位点与单倍型数目,计算了核苷酸多样度和单倍型多样度.结果表明8条野牦牛线粒体DNA D-loop 区全序列长度在891~894 bp之间,其中A、T、G和C 4种核苷酸的平均含量分别为32.68%、28.65%、13.46%和25.21%,A+T的平均含量为61.33%.排除4处核苷酸的插入或缺失后,共检测到39处转换和颠换位点,占分析序列总长度的4.38%,其中包括4处单一多态位点和35处简约信息位点.依据序列间核苷酸变异共确定了7种单倍型,单倍型多样度(h)为0.9643,核苷酸多样度(π)为0.02144,提示野牦牛群体具有丰富的遗传多样性.

关 键 词:野牦牛  线粒体DNA  D-Loop区  遗传多样性
收稿时间:2008/12/30 0:00:00
修稿时间:2009/6/18 0:00:00

Genetic diversity in the mtDNA D\|Loop region of wild yak (Bos grunniens mutus)
Ma zhijie.Genetic diversity in the mtDNA D\|Loop region of wild yak (Bos grunniens mutus)[J].Acta Ecologica Sinica,2009,29(9):4798-4803.
Authors:Ma zhijie
Abstract:
Keywords:wild yak  mitochondrial DNA  D\|loop region  genetic diversity
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