| 在PCR-DGGE研究土壤微生物多样性中应用GC发卡结构的效应 |
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| 引用本文： | 罗海峰,齐鸿雁,薛凯,王晓谊,王川,张洪勋.在PCR-DGGE研究土壤微生物多样性中应用GC发卡结构的效应[J].生态学报,2003,23(10):2170-2175. |
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| 作者姓名： | 罗海峰 齐鸿雁 薛凯 王晓谊 王川 张洪勋 |
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| 作者单位： | 中国科学院生态环境研究中心环境生物技术研究室,北京,100085 |
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| 基金项目： | 国家“十五”科技攻关重点资助项目 ( 2 0 01BA90 3B)~~ |
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| 摘 要： | 应用普通细胞裂解法提取 3株实验菌株 (Escherichia coli DH5α,Staphylococcus aureus SA- 1和 A-grobacterium tumerfaciens 1 31 2 9)的基因组 DNA和应用基于高盐和长时高热的细胞裂解法提取 7种不同土壤样品中的微生物的基因组 DNA,两组不同结构的引物 F3 57GC,R51 8(在正向引物的 5′端有 GC发卡结构 )和 F3 57,R51 8,分别对实验菌株和土壤样品中微生物的 1 6Sr RNA基因 V3区进行扩增 ,均得到了目的片段。比较了不同引物扩增的 1 6S r DNA片段在 DGGE中的不同电泳行为 ,结果表明 ,含 GC发卡结构的PCR扩增产物在 DGGE中能够得到很好的分离 ,而无 GC发卡结构的 PCR产物则不能在 DGGE中获得满意分离。引入 GC发卡结构 ,使得对不同微生物的定性和分类更深入细致
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| 关 键 词： | PCR—DGGE 微生物多样性 GC发卡结构 |
| 文章编号： | 1000-0933(2003)10-2170-06 |
| 收稿时间： | 2003/3/28 0:00:00 |
| 修稿时间： | 2003/5/13 0:00:00 |
Influence of application of GC-clamp on study of soil microbial diversity by PCR-DGGE |
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| LUO Haifeng,QI Hongyan,XUE Kai,WANG Xiaoyi,WANG Chuan and ZHANG Hongxun.Influence of application of GC-clamp on study of soil microbial diversity by PCR-DGGE[J].Acta Ecologica Sinica,2003,23(10):2170-2175. |
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| Authors: | LUO Haifeng QI Hongyan XUE Kai WANG Xiaoyi WANG Chuan and ZHANG Hongxun |
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| Institution: | Environmental Biotechnology Lab.; Research Center for Eco Environmental Sciences; Chinese Academy of Sciences; Beijing; China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | PCR DGGE microbial diversity GC clamp |
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