| 拟南芥丝氨酸羧肽酶类蛋白家族的基因组学分析 |
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| 引用本文： | 冯英,刘庆坡,贾佳,薛庆中.拟南芥丝氨酸羧肽酶类蛋白家族的基因组学分析[J].遗传学报,2005,32(8):864-873. |
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| 作者姓名： | 冯英 刘庆坡 贾佳 薛庆中 |
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| 作者单位： | 浙江大学农业与生物技术学院,杭州,310029 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金（编号：39870421）和浙江省重点科研项目（编号：2003C22007） |
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| 摘 要： | 基于隐马可夫模型，利用已知丝氨酸羧肽酶（Serine Carboxypeptidases，SCP）氨基酸序列作为训练集，搜索拟南芥全蛋白质组数据库，鉴定了54个推定的SCPL（丝氨酸羧肽酶类，Serine Carboxypeptidase-Like）基因，详细分析了各基因的结构特征、染色体定位与编码的蛋白质序列，发现7个可能最近发生复制事件的基因簇聚区，并且其SCPL基因广泛存在交替剪接方式。系统进化分析表明，88．9％基因编码的蛋白质属于双链羧肽酶Ⅰ或Ⅱ亚族，仅11．1％蛋白质属于单链羧肽酶Ⅲ亚族，暗示SCP蛋白不仅具有独特拓扑结构的催化中心与高度保守的“α/β水解酶折叠”三级结构，其DNA或蛋白质序列特征也可以作为系统进化研究依据。
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| 关 键 词： | 丝氨酸羧肽酶 基因家族 拟南芥 系统发生 进化 |
| 文章编号： | 0379-4172（2005）08-0864-10 |
| 收稿时间： | 2004-04-19 |
| 修稿时间： | 2004-04-19 |
Genomic Analysis of Serine Carboxypeptidase-like Protein Family of Arabidopsis thaliana |
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| FENG Ying,LIU Qing-Po,JlA Jia,XUE Qing-Zhong.Genomic Analysis of Serine Carboxypeptidase-like Protein Family of Arabidopsis thaliana[J].Journal of Genetics and Genomics,2005,32(8):864-873. |
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| Authors: | FENG Ying LIU Qing-Po JlA Jia XUE Qing-Zhong |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | serine carboxypeptidase gene family Arabidopsis thaliana phylognetic evolution |
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