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| 应用寡核苷酸芯片并行检测CYP1A1和 GSTM1基因多态性 | |
| 引用本文： | 刘三震,李瑶,李荣宇,裘敏燕,沈卫文,顾珈媛,王玉,孙美倩,毛裕民,谢毅.应用寡核苷酸芯片并行检测CYP1A1和 GSTM1基因多态性[J].遗传学报,2004,31(10):1045-1052. |
| 作者姓名： | 刘三震 李瑶 李荣宇 裘敏燕 沈卫文 顾珈媛 王玉 孙美倩 毛裕民 谢毅 |
| 作者单位： | 1. 上海博星基因芯片有限责任公司,上海,200092 2. 复旦大学生命科学学院遗传学研究所遗传工程国家重点实验室,上海,200433 3. 联合基因科技集团有限公司,上海,200092 |
| 基金项目： | 国家高技术研究发展计划资助项目 (“863计划”) (No .2 0 0 2AA2Z2 0 0 2 )~~ |
| 摘 要： | 利用寡核苷酸芯片检测方法分析CYP1A1单核苷酸多态性 (SNP)和GSTM1缺失与否 ,实验结果证明了寡核苷酸芯片技术可并行、准确、高效地检测基因的单核苷酸多态性和其他类型的基因多态型 ,可为疾病遗传易感性及单体型的研究提供强有力的研究工具。采用该寡核苷酸芯片 ,检测了 84份正常人的血液DNA样本 ,其中GSTM1基因缺失率达到 4 7 6 % ,接近报道数值。统计分析发现 ,CYP1A1m1 m2的 3种基因型组合TT AG、TT GG和TC GG的发生频率都为 0 ,而根据实验得到的m1和m2各自基因型数据计算 ,它们的发生频率应是11 4 %、2 6 %和 3 1% ,所以推测在所检测的样本中没有T(m1位点 )和G(m2位点 )的连锁组合 ,即m1和m2位点的组合只有 3种单体型 :T A、C A和C G ,其发生频率分别是 6 9 6 %、7 7%和 2 2 6 %。 |
| 关 键 词： | 单核苷酸多态性 CYP1A1 GSTM1 寡核苷酸芯片 单体型 |
| 文章编号： | 0379-4172(2004)10-1045-08 |
| 修稿时间： | 2003年10月23 |
Detecting Genetic Polymorphisms of CYP1 A1 and GSTM1 Simultaneously with Oligonucleotide Microarray |
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| LIU San-Zhen.Detecting Genetic Polymorphisms of CYP1 A1 and GSTM1 Simultaneously with Oligonucleotide Microarray[J].Journal of Genetics and Genomics,2004,31(10):1045-1052. | |
| Authors: | LIU San-Zhen |
| Institution: | LIU San-Zhen~ |
| Abstract: | |
| Keywords: | single nucleotide polymorphism CYP1A1(cytochrome P4501A1) GSTM1(glutathione S-transferase M1) oligonucleotide microarray haplotypes |
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