| 水稻14-3-3蛋白家族的生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 金谷雷,汪旭升,朱军.水稻14-3-3蛋白家族的生物信息学分析[J].遗传学报,2005,32(7):726-732. |
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| 作者姓名： | 金谷雷 汪旭升 朱军 |
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| 作者单位： | 浙江大学生物信息学研究所,杭州,310029 |
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| 基金项目： | 国家“863”计划(编号:2002AA234031)资助~~ |
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| 摘 要： | 通过隐马尔柯夫模型(Hidden Markov Model，HMM)，对粳稻(Oryza sativa L.ssp．japonica)基因组的蛋白质数据库进行搜索，结果获得8个14—3—3蛋白的同源序列，其中发现4个新基因。通过对所有粳稻的14—3—3蛋白的DNA序列与各种表达序列标签(Expression Sequence Tags，ESTs)进一步比对，为14-3-3蛋白找到了ESTs的证据。结果说明这些基因在水稻不同的处理和不同的部位都有所表达，而且不同成员之间的表达模式存在较大的差异。蛋白质多序列联配分析结果表明，存在可能的功能多态位点。通过基因结构和染色体定位的分析，确认了水稻基因组中存在E样和非E样两类14-3-3蛋白。此外，对目前植物中的14—3—3家族作了初步的进化分析。
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| 关 键 词： | 14-3-3蛋白 生物信息学分析 家族 隐马尔柯夫模型 Markov 蛋白质数据库 表达序列标签 Model DNA序列 染色体定位 水稻基因组 同源序列 ESTs 表达模式 分析结果 多态位点 基因结构 进化分析 行搜索 sp． 新基因 粳稻 植物 |
| 文章编号： | 0379-4172(2005)07-0726-07 |
Bioinformatic Analysis of the 14-3-3 Gene Family in Rice |
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| JIN Gu-Lei,WANG Xu-sheng,ZHU Jun.Bioinformatic Analysis of the 14-3-3 Gene Family in Rice[J].Journal of Genetics and Genomics,2005,32(7):726-732. |
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| Authors: | JIN Gu-Lei WANG Xu-sheng ZHU Jun |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | rice 14-3-3 protein gene family phylogenic analysis gene structure |
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