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香樟全基因组WRKY基因家族的鉴定与分析
引用本文:倪辉,孙维红,丁乐,曾伟伟,邹双全.香樟全基因组WRKY基因家族的鉴定与分析[J].植物科学学报,2022,40(4):513-523.
作者姓名:倪辉  孙维红  丁乐  曾伟伟  邹双全
作者单位:1. 福建农林大学林学院, 福州 350002; 2. 自然生物资源保育利用福建省高校工程研究中心, 福州 350002
基金项目:中央财政林业科技推广示范项目(闽[2020]TG07号);福建省林业科技项目(2021FKJ19)。
摘    要:WRKY转录因子基因家族是植物特有的一类基因,在植物次生代谢、生物和非生物胁迫中起着重要的调节作用。本研究通过生物信息学方法,在香樟(Cinnamomum camphora (L.) Presl.)全基因组中鉴定了60个WRKY基因(CcWRKY),并将其分为Group Ⅰ~ Ⅲ,其中,Group Ⅰ和Ⅲ的成员发生了收缩现象;片段复制是CcWRKY基因扩张的主要驱动力;Group Ⅰ有完整的WRKY结构域和锌指基序,但Group Ⅱ、Ⅲ存在结构域和锌指基序的丢失和变异现象;CcWRKY基因的启动子区域具有激素类和胁迫类响应顺式作用元件;基因表达分析结果显示,在贫瘠环境(未施肥)中大多数CcWRKY基因在香樟各个组织中高表达,而环境适宜(施肥)条件下,基因表达量降低。

关 键 词:香樟  WRKY基因  转录因子  生物信息学  表达谱  
收稿时间:2022-06-08

Identification and analysis of the WRKY gene family in whole genome of Cinnamomum camphora(L.) Presl.
Ni Hui,Sun Wei-Hong,Ding Le,Zeng Wei-Wei,Zou Shuang-Quan.Identification and analysis of the WRKY gene family in whole genome of Cinnamomum camphora(L.) Presl.[J].Plant Science Journal,2022,40(4):513-523.
Authors:Ni Hui  Sun Wei-Hong  Ding Le  Zeng Wei-Wei  Zou Shuang-Quan
Institution:1. College of Forestry, Fujian Agriculture and Forestry University, Fuzhou 350002, China; 2. Natural Biological Resources Conservation and Utilization, Fujian University Engineering Research Center, Fuzhou 350002, China
Abstract:
Keywords:
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