火龙果转录组测序、基因表达与功能分析 |
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引用本文: | 魏开发,李艺宣.火龙果转录组测序、基因表达与功能分析[J].植物科学学报,2019(2):198-210. |
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作者姓名: | 魏开发 李艺宣 |
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作者单位: | 闽南师范大学生物科学与技术学院 |
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基金项目: | 福建省产业技术开发与应用计划对外合作项目(2015I0006)~~ |
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摘 要: | 利用高通量测序技术对火龙果(Hylocereus undulatus Britt)红肉品种‘大红二号’的花芽、果实和枝条不同发育阶段的基因表达进行研究。结果显示,转录组测序共获得468.68 Gb原始数据(Raw data),从头组装获得239 152条转录本和162 519条unigene,约53.74%的unigene得到注释。分别在43 506条和16 251条unigene中检测到600 283个SNP位点和56 147个SSR位点。基因表达分析结果表明,在火龙果不同组织Fl510、Fl513、Fl514、Fl518、F711、F715、S513、S419中分别有31、7、5、152、17、63、17、8个特异表达的unigene。通过GO和KEGG富集分析,发现了一些组织特异的GO条目和代谢通路,如在Fl510中富集的类萜骨架生物合成代谢通路等。本研究还对参与花发育的候选基因进行了鉴定和表达分析,他们包括COL基因、FT-like基因、分生组织决定基因和器官决定基因等。
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关 键 词: | 火龙果 转录组测序 生长 花发育 基因表达 |
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