| 橡胶树橡胶生物合成调控相关基因的表达相关性分析 |
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| 引用本文： | 杨署光,杨秀光,赵 悦,史敏晶,李 言,邓小敏,晁金泉,田维敏.橡胶树橡胶生物合成调控相关基因的表达相关性分析[J].广西植物,2020,40(12):1790-1799. |
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| 作者姓名： | 杨署光 杨秀光 赵 悦 史敏晶 李 言 邓小敏 晁金泉 田维敏 |
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| 作者单位： | 1. 中国热带农业科学院橡胶研究所、农业农村部橡胶树生物学与遗传资源利用重点实验室、省部共建国家重点实验室
培育基地-海南省热带作物栽培生理学重点实验室, 海南 儋州 571737; 2. 云南省临沧市沧源佤族自治县勐角
民族乡农业综合服务中心, 云南 临沧 677401; 3. 中国农业大学 农学院, 北京 100193 |
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| 基金项目： | 国家重点研发计划项目(2018YFD1000502); 国家青年科学基金(31800578,31700601,31800577); 国家天然橡胶产业技术体系分子育种岗位专项项目(CARS-34-GW1)[Supported by the National Key R & D Program of China(2018YFD1000502); the National Natural Science Foundation for Youth(31800578, 31700601, 31800577); Earmarked Fund for China Agriculture Research System(CARS-34-GW1)]。 |
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| 摘 要： | 该文通过qPCR获得了正常割胶条件下,9个茉莉酸信号途径关键环节基因HbCOI1、HbJAZ1、HbJAZ2、HbJAZ3、HbMYC1、HbMYC2、HbMYC3、HbMYC4、HbMYC5和6个橡胶生物合成相关基因HbHRT2、HbSRPP、HbREF、HbHMGR1、HbHRT1、HbGAPDH在5个橡胶树魏克汉种质和5个1981''IRRDB种质胶乳中的表达数据; 通过皮尔逊相关系数分析了这15个基因彼此间的表达相关性,分别获得105对基因的双变量相关系数(r12)和偏相关系数(r12.3),所有105对基因的双变量相关系数(︱r12︱)和偏相关系数(︱r12.3︱)的平均值分别为0.486 ± 0.220和0.304 ± 0.211,达到0.05的差异显著水平。其中,r12与r12.3方向相同的63对(60%),方向相反的42对(40%); ︱r12︱<︱r12.3︱的23对(21.905%),︱r12︱>︱r12.3︱的82对(78.095%); 双变量相关显著性P<0.05的76对(72.38%),P<0.01的59对(56.19%); 偏相关显著性P<0.05的21对(20%),P<0.01的16对(15.24%)。结果显示,这两条途径中的基因表达彼此相关,这为基因表达谱分析中普遍采用的前提假设“功能相关基因的表达相关”提供了进一步的实验证据,可用于挖掘、筛选和预测与橡胶生物合成相关的未知基因,为研究橡胶树产量形成的分子调控机理提供理论基础。
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| 关 键 词： | 巴西橡胶树 割胶 茉莉酸信号途径 橡胶生物合成 基因表达 Pearson相关 |
| 收稿时间： | 2019/7/10 0:00:00 |
Correlation analysis on expression of genes
related to rubber biosynthesis regulation of rubber tree |
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| YANG Shuguang,YANG Xiuguang,ZHAO Yue,SHI Minjing,LI Yan,DENG Xiaomin,CHAO Jinquan,TIAN Weimin.Correlation analysis on expression of genes
related to rubber biosynthesis regulation of rubber tree[J].Guihaia,2020,40(12):1790-1799. |
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| Authors: | YANG Shuguang YANG Xiuguang ZHAO Yue SHI Minjing LI Yan DENG Xiaomin CHAO Jinquan TIAN Weimin |
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| Institution: | 1. Rubber Research Institute, Chinese Academy of Tropical Agricultural Sciences/Key Laboratory of Rubber Biology and Genetic Resources of
Rubber Tree, Minstry of Agriculture and Rural Affairs, P. R. China/State Key Laboratory Incubation Base for Hainan Provincial Cultivation &
Physiology of Tropical Crops, Danzhou 571737, Hainan, China; 2. Comprehensive Agricultural Service Center of Mengjiao Nationality
Township, Cangyuan WA Autonomous County, Lincang 677401, Yunnan, China; 3. College of Agronomy and Biotechnology,
China Agricultural University, Beijing 10093, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Hevea brasiliensis tapping jasmonate signaling rubber biosynthesis gene expression Pearson correlation |
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