| 质体系统发育基因组解析旋花科系统发育关系 |
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| 引用本文： | 陈丽琼,张志荣,杨俊波,李德铢,郁文彬.质体系统发育基因组解析旋花科系统发育关系[J].广西植物,2022,42(10):1740-1749. |
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| 作者姓名： | 陈丽琼 张志荣 杨俊波 李德铢 郁文彬 |
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| 作者单位： | 1. 中国科学院西双版纳热带植物园 综合保护中心, 云南 勐腊 666303; 2. 中国科学院大学, 北京 100049; 3. 中国科学院
昆明植物研究所 中国西南野生生物种质资源库, 昆明 650201; 4. 中国科学院核心植物园保护生物学协同中心,
云南 勐腊 666303; 5. 中国科学院东南亚生物多样性研究中心, 云南 勐腊 666303 |
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| 基金项目： | 中国科学院重大科技基础设施开放研究项目(2017-LSF-GBOWS-02); 云南省万人计划“青年拔尖人才”项目 [Supported by the Large-Scale Scientific Facilities of Chinese Academy of Sciences(2017-LSF-GBOWS-02); Ten Thousand Talents Program of Yunnan for Top-notch Young Talents]。 |
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| 摘 要： | 旋花科是一个世界广布的类群,具有丰富的形态特征和重要的经济价值。然而,目前该科主要分支或族间的系统发育关系问题一直未解决。为解析旋花科内系统发育关系,该研究代表性选取旋花科内8个族40个物种,基于质体全基因组数据,使用最大似然法和贝叶斯推论进行系统发育分析。结果表明:(1)旋花科质体基因组均为四分体结构,质体基因组大小为113 273～164 112 bp,蛋白质编码基因数目为66～79个。(2)基于五种DNA矩阵(即WCG、CDS、LSC、IR、SSC)的系统发育分析结果显示,WCG矩阵和CDS矩阵的拓扑结构基本一致,仅少数分支的支持率略有差异; LSC矩阵和WCG矩阵的拓扑结构差异在于菟丝子族、马蹄金族和盐帚花族的系统位置; AU检验和SH检验结果显示,WCG矩阵和SSC矩阵与IR矩阵的拓扑结构有显著冲突。(3)所有系统发育分析结果均显示,菟丝子属和马蹄金族都包括在旋花亚科内,应处理为族等级。(4)基于WCG矩阵和CDS矩阵较好地解决了旋花科8个族之间的系统发育关系,即心被藤族和丁公藤族聚为一支,最先从旋花亚科分化出来,随后是菟丝子族,剩下的5个族分成2个分支。(5)系统发育基因组分析证实,由于鱼黄草族特别是鱼黄草属是一个多系类群,因此需重新修订该族的分类地位和鱼黄草属的划分。
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| 关 键 词： | 旋花科 系统发育关系 质体基因组 菟丝子属 鱼黄草族 |
| 收稿时间： | 2021/7/19 0:00:00 |
Plastid phylogenomic insights into the
phylogeny of Convolvulaceae |
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| CHEN Liqiong,ZHANG Zhirong,YANG Junbo,LI Dezhu,YU Wenbin.Plastid phylogenomic insights into the
phylogeny of Convolvulaceae[J].Guihaia,2022,42(10):1740-1749. |
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| Authors: | CHEN Liqiong ZHANG Zhirong YANG Junbo LI Dezhu YU Wenbin |
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| Institution: | 1. Center for Integrative Conservation, Xishuangbanna Tropical Botanical Garden, Chinese Academy of Sciences, Mengla 666303, Yunnan, China;
2. University of Chinese Academy of Sciences, Beijing 100049, China; 3. The Germplasm Bank of Wild Species, Kunming Institute of Botany,Chinese
Academy of Sciences, Kunming 650201, China; 4. Center of Conservation Biology, Core Botanical Gardens, Chinese Academy of Sciences,Mengla
666303, Yunnan, China; 5. Southeast Asia Biodiversity Research Institute, Chinese Academy of Science, Mengla 666303, Yunnan, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Convolvulaceae phylogenetic relationship plastome Cuscuta Merremieae |
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