| 思茅松HDR基因全长cDNA克隆与序列分析 |
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| 引用本文： | 王 毅,周 旭,毕 玮,杨宇明,李 江,王 娟.思茅松HDR基因全长cDNA克隆与序列分析[J].广西植物,2015,35(5):721-727. |
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| 作者姓名： | 王 毅 周 旭 毕 玮 杨宇明 李 江 王 娟 |
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| 作者单位： | 1. 云南林业科学院 国家林业局云南珍稀濒特森林植物繁育和保护重点实验室, 昆明650201; 2. 云南林业学科院,
云南省森林植物培育与开发利用重点实验室, 昆明 650201; 3. 西南林业大学, 昆明 650224 |
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| 摘 要： | 1-羟基-2-甲基-2-E-丁烯基-4-焦磷酸还原酶(HDR)是甲基-D-赤藓醇-4-磷酸(MEP)途径中的最后一个酶,在植物萜类生物合成中起主控作用。该研究根据思茅松(Pinus kesiya var.langbianensis)树皮转录组数据分析结果,首先获得了思茅松HDR基因片段,然后根据所获得的基因片段设计特异引物,提取受伤后的思茅松树皮的RNA,并运用RT-PCR和RACE技术从思茅松树皮中克隆得到完整的HDR基因(Pk HDR)。生物信息学分析表明:克隆获得的Pk HDR1基因c DNA全长序列为1 876 bp,含有1个1 464 bp的开放阅读框(ORF),编码487个氨基酸。同源性分析结果表明:思茅松HDR蛋白与赤松(Pinus densiflora)HDR蛋白的相似性高达99%。亚细胞定位及结构域分析结果表明:思茅松Pk HDR氨基酸序列中包含转运肽序列(A1-A61)及植物HDR蛋白多个保守的功能位点(A143,A234,A288,A371)。系统进化分析结果表明:Pk HDR蛋白与赤松HDR蛋白的亲缘关系最为接近。半定量PCR检测结果表明:树皮的创伤促进思茅松HDR基因的表达。该研究成功克隆获得HDR基因,并确定其与松脂代谢密切相关,为阐明思茅松松脂生物合成机制和分子育种提供了参考。
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| 关 键 词： | 思茅松 HDR cDNA 克隆 基因功能分析 半定量PCR |
Cloning and sequence analysis of 1-hydroxy-2-methyl-
2-(E)-butenyl-4-diphosphate reductase gene cDNA
from Pinus kesiya var. langbianensis |
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| WANG Yi,ZHOU Xu,BI Wei,YANG Yu-Ming,LI Jiang,WANG Juan.Cloning and sequence analysis of 1-hydroxy-2-methyl-
2-(E)-butenyl-4-diphosphate reductase gene cDNA
from Pinus kesiya var. langbianensis[J].Guihaia,2015,35(5):721-727. |
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| Authors: | WANG Yi ZHOU Xu BI Wei YANG Yu-Ming LI Jiang WANG Juan |
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| Institution: | 1. Key Laboratory of Rare and Endangered Forest Plants of State Forestry Administration, Yunnan Academy of Forestry,
Kunming 650204, China; 2. Key Laboratory of Foresty Plant Cultivation and Utilization; Yunnan Academy of Forestry
Kunming 650204, China; 3. Faculty of Forestry, Southwest Forestry University, Kunming 650204, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Pinus kesiya var langbianensis 1-hydroxy-2-methyl-2-(E)-butenyl 4-diphosphate reductase gene cDNA clone gene function analysis RT-PCR |
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