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鹅掌楸AOX家族基因克隆与组织表达分析
引用本文:宗亚仙,郝自远,王 曦,温少莹,李火根.鹅掌楸AOX家族基因克隆与组织表达分析[J].广西植物,2020,40(7):988-997.
作者姓名:宗亚仙  郝自远  王 曦  温少莹  李火根
作者单位:南京林业大学 南方现代林业协同创新中心, 南京 210037
基金项目:国家自然科学基金(31770718,31470660); 江苏省高校优势学科(PAPD)项目 [Supported by the National Natural Science Foundation of China(31770718, 31470660); Priority Academic Program Development of Jiangsu Higher Education Institutions(PAPD)]。
摘    要:鹅掌楸(Liriodendron chinense)为重要的珍贵用材及园林观赏树种,开展抗逆基因的研究,对于提高鹅掌楸适应性有重要意义。该文以鹅掌楸为研究对象,通过采用RT-qPCR与RACE相结合的方法克隆获得3个AOX基因,其ORF长分别为858、1 032、1 044 bp,相应编码氨基酸数为285、343、347 aa,分别命名为LcAOX1a、LcAOX1b和LcAOX2。蛋白同源性分析发现鹅掌楸AOX家族蛋白序列高度保守,尤其在C端保守性极高,且均含有"EXXH"、"EEE-Y"铁离子结合保守结构域。亚细胞定位分析结果显示LcAOX1a蛋白定位于线粒体及叶绿体之外的其他位置,LcAOX1b蛋白在叶绿体和线粒体中均有定位,LcAOX2蛋白定位于线粒体基质。采用RT-qPCR方法研究AOX基因在鹅掌楸茎、叶片、叶芽、花芽、花萼、花瓣、雄蕊、雌蕊8个不同组织中的表达模式,分析发现鹅掌楸AOX基因在花器官中表达量明显高于营养器官,LcAOX1a与LcAOX1b基因在雄蕊中表达量最高,特别是LcAOX1a基因在雄蕊中特异性表达,其表达量远远高于其他组织;LcAOX2基因在花瓣中表达量最高。该研究克隆3个鹅掌楸AOX基因并进行相关分析,为进一步研究其生物学功能奠定了基础。

关 键 词:鹅掌楸    交替氧化酶    基因克隆    生物信息学分析    组织表达
收稿时间:2019/7/24 0:00:00

Molecular isolation and tissue expression analysis of alternative oxidase family genes in Liriodendron chinensis
ZONG Yaxian,HAO Ziyuan,WANG Xi,WEN Shaoying,LI Huogen.Molecular isolation and tissue expression analysis of alternative oxidase family genes in Liriodendron chinensis[J].Guihaia,2020,40(7):988-997.
Authors:ZONG Yaxian  HAO Ziyuan  WANG Xi  WEN Shaoying  LI Huogen
Institution:Southern Modern Forestry Collaborative Innovation Center, Nanjing Forestry University, Nanjing 210037, China
Abstract:
Keywords:Liriodendron chinensis  alternative oxidase  molecular isolation  bioinformatics analysis  tissue expression
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