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不同产区厚朴nrDNA ITS序列分析及亲缘关系鉴定
引用本文:王洁,杨旭,杨志玲.不同产区厚朴nrDNA ITS序列分析及亲缘关系鉴定[J].广西植物,2013(1):35-41.
作者姓名:王洁  杨旭  杨志玲
作者单位:中国林业科学研究院 亚热带林业研究所, 浙江 富阳 311400
摘    要:以陕西、四川、浙江、重庆、福建、广西主产区的11个种源厚朴为材料,采用PCR直接测序法,测定不同产区厚朴的核糖体DNA ITS区序列,并结合GeneBank中相关植物的ITS序列(以同属近缘物种辛夷为外类群),应用Kimura 2遗传距离与NJ系统树分析法对不同产区厚朴的亲缘关系进行分析。结果表明:11个产区厚朴的ITS全序列长度介于593~600 bp,其中,ITS1长度为214~217 bp,G+C含量为54.42%~5535%,ITS2长度为215~219 bp,G+C含量为59.82%~60.95%;ITS序列共有36个变异位点,均出现在ITS1(7个)和ITS2(29个)序列中,虽然位点变异与部分叶形变化出现吻合,但无必然联系;序列间遗传分化距离为0.000~0.02792,11个产区厚朴构成3个分支,显示出产区间厚朴的亲缘关系,其中陕西洋县(SXYX)、陕西西乡(SXXX)、福建武夷山(FJWYS)及四川彭州(SCPZ)四个产区ITS序列完全一致。nrDNA ITS序列分析可作为厚朴不同产区亲缘关系鉴定的手段。

关 键 词:nrDNA  ITS序列    厚朴    系统聚类    亲缘关系
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