| 毛竹APX基因系统进化与表达分析 |
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| 引用本文： | 章 妮,陈克龙,崔博亮,杨 阳.毛竹APX基因系统进化与表达分析[J].广西植物,2021,41(12):1964-1973. |
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| 作者姓名： | 章 妮 陈克龙 崔博亮 杨 阳 |
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| 作者单位： | 1. 青海师范大学 生命科学学院, 西宁 810008; 2. 青海省自然地理与环境过程重点实验室,
西宁 810008; 3. 青海师范大学科技处, 西宁 810008 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金(41661023)[Supported by the National Natural Science Foundation of China(41661023)]。 |
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| 摘 要： | 抗坏血酸过氧化物酶(aseorbate peroxidase, APX)是植物活性氧代谢中重要的抗氧化酶之一,尤其是叶绿体中清除H2O2的关键酶,也是维生素C代谢的主要酶类。该文基于生物信息学方法,利用毛竹的基因组及转录组数据鉴定毛竹中的APX基因家族成员,并对其编码的蛋白基本理化性质、基因结构、启动子元件、系统进化及共线性关系、重复串联基因、GO注释及表达模式进行综合分析,共鉴定出21种编码APX的基因。结果表明:(1)PeAPX基因家族成员多为不稳定疏水蛋白,基因结构、基序及结构域相对较为保守,大多数APX基因具有高度保守的内含子模式。(2)系统进化关系显示毛竹APX基因与水稻APX基因有着较高的同源性关系,PeAPX具有较高的进化保守性。(3)Ka/Ks分析表明PeAPX基因都经历了纯化选择压力,此外在每个APX基因的启动子序列中发现有许多与应激反应和植物激素相关的顺式作用元件,结合表达量分析,表明毛竹APX基因在毛竹生长发育中起着正向促进作用。该研究为进一步了解毛竹APX基因家族基本功能及其抗氧化机制提供了一定的参考,为毛竹APX基因功能的深层次鉴定提供了重要依据。
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| 关 键 词： | 毛竹 APX基因家族 生物信息学 系统进化 基因表达 |
| 收稿时间： | 2020/9/25 0:00:00 |
Phylogenetic evolution and expression analysis
of APX gene in Phyllostachys edulis |
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| ZHANG Ni,CHEN Kelong,CUI Boliang,YANG Yang.Phylogenetic evolution and expression analysis
of APX gene in Phyllostachys edulis[J].Guihaia,2021,41(12):1964-1973. |
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| Authors: | ZHANG Ni CHEN Kelong CUI Boliang YANG Yang |
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| Institution: | 1. College of Life Science, Qinghai Normal University, Xining 810008, China; 2. Qinghai Provincial Key Laboratory of Physical Geography and
Environmental Processes, Xining 810008, China; 3. Science and Technology Department, Qinghai Normal University, Xining 810008, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Phyllostachys edulis APX gene family bioinformatics phylogenetic evolution gene expression |
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