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烟草叶绿体基因组和线粒体基因组SSR位点分析
引用本文:李绪英,肖炳光,高玉龙,姬广海.烟草叶绿体基因组和线粒体基因组SSR位点分析[J].西北植物学报,2011,31(12).
作者姓名:李绪英  肖炳光  高玉龙  姬广海
作者单位:1. 云南农业大学,昆明650201;云南省烟草农业科学研究院,云南 玉溪653100
2. 云南省烟草农业科学研究院,云南 玉溪,653100
3. 云南农业大学,昆明,650201
基金项目:中国烟草总公司项目,中国烟草总公司云南省公司项目
摘    要:利用生物信息学方法对烟草叶绿体和线粒体基因组数据中的SSR信息进行了分析.结果表明,在叶绿体和线粒体基因组中分别获得186和578个SSR位点,SSR间的平均距离分别为838 bp和745 bp.在SSR的分布区域上,绝大多数SSR位点分布在UTR(尤其是5’UTR)区域;在SSR重复碱基类型上,主要集中在二、三碱基重复,二者占总SSR位点的90%以上,其中三碱基重复类型丰度最高.利用全部657对SSR引物在供试的10份烟草材料中进行扩增,发现所有引物均能获得目的片段,但在普通烟草内品种间并未检测到多态性,而在烟草种间有26对叶绿体基因组SSR引物和178对线粒体基因组SSR引物扩增出多态性条带,表明来源于烟草叶绿体基因组和线粒体基因组的SSR标记适合用于烟草种间进化、分类、遗传多样性等方面研究.

关 键 词:烟草  叶绿体基因组  线粒体基因组  SSR

Analysis of SSR Loci in Chloroplast Genome and Mitochondria Genome of Tobacco (Nicotiana)
LI Xu-ying , XIAO Bing-guang , GAO Yu-long , JI Guang-hai.Analysis of SSR Loci in Chloroplast Genome and Mitochondria Genome of Tobacco (Nicotiana)[J].Acta Botanica Boreali-Occidentalia Sinica,2011,31(12).
Authors:LI Xu-ying  XIAO Bing-guang  GAO Yu-long  JI Guang-hai
Abstract:
Keywords:
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