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秋石斛钙依赖蛋白激酶基因的克隆及表达分析
引用本文:林榕燕,钟淮钦,陈艺荃,方能炎,孔 兰,叶秀仙.秋石斛钙依赖蛋白激酶基因的克隆及表达分析[J].西北植物学报,2022,42(11):1818-1826.
作者姓名:林榕燕  钟淮钦  陈艺荃  方能炎  孔 兰  叶秀仙
作者单位:(1 福建省农业科学院作物研究所/福建省特色花卉工程技术研究中心,福州 350013;2 福建省农业科学院农业工程技术研究所,福州 350003)
基金项目:福建省省属公益类科研院所项目 (2022R1031009);
摘    要:钙依赖蛋白激酶(calcium dependent protein kinase,CDPK)在植物的生长发育及逆境胁迫方面发挥着重要作用。该研究以秋石斛品种‘水芙蓉’为试验材料,采用 RT PCR方法克隆钙依赖蛋白激酶基因,并对其进行生物信息学分析;采用qRT PCR方法对CDPKs基因在‘水芙蓉’不同组织及不同低温胁迫下的表达情况进行分析,为秋石斛CDPK基因的功能验证以及抗寒分子机制研究奠定基础。结果表明:(1)成功克隆获得了DenCDPK1(GenBank登录号为MZ322902)、DenCDPK2(GenBank登录号为MZ322903)、DenCDPK3(GenBank登录号为MZ322904)基因,序列长度依次为1 934、1 971和2 302 bp,分别编码534、541和536个氨基酸。 (2)序列一致性结果显示,DenCDPKs蛋白质与铁皮石斛相应CDPK蛋白质序列的一致性均高于97%,且DenCDPKs均存在STKc_CAMK结构域和4个EF hand结构域。(3)qRT PCR分析显示,DenCDPK1、DenCDPK2和DenCDPK3基因均在叶中高表达,分别在茎、花、茎中低表达;且‘水芙蓉’叶片中DenCDPK1和DenCDPK2的表达量高于其他3个供试品种;经8 ℃胁迫12 h后,叶片中DenCDPKs的表达量均显著高于对照组(25 ℃条件下),且DenCDPK3的表达量在0 ℃胁迫12 h时达到最高值。(4)常温(25 ℃)下‘水芙蓉’叶片中的相对电导率显著低于其他3个供试品种;经低温(8 ℃、0 ℃)胁迫12 h后,叶片中的相对电导率均显著高于对照组,且随温度的降低呈上升趋势。研究认为,DenCDPKs基因可能参与秋石斛低温胁迫的响应过程,特别是DenCDPK2可能在秋石斛抗寒过程中发挥着重要作用。

关 键 词:秋石斛  CDPK基因  克隆    qRT  PCR

Cloning and Expression Analysis of Calcium dependent Protein Kinase Gene in Dendrobium spp.
LIN Rongyan,ZHONG Huaiqin,CHEN Yiquan,FANG Nengyan,KONG Lan,YE Xiuxian.Cloning and Expression Analysis of Calcium dependent Protein Kinase Gene in Dendrobium spp.[J].Acta Botanica Boreali-Occidentalia Sinica,2022,42(11):1818-1826.
Authors:LIN Rongyan  ZHONG Huaiqin  CHEN Yiquan  FANG Nengyan  KONG Lan  YE Xiuxian
Abstract:
Keywords:Dendrobium spp    CDPK gene  cloning  qRT PCR
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