| 基于RNA-Seq的向日葵脂肪酸合成基因筛选与分析 |
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| 引用本文： | 郭树春,张艳芳,李素萍,邵盈,邢慧军,于海峰.基于RNA-Seq的向日葵脂肪酸合成基因筛选与分析[J].西北植物学报,2023,43(10):1663-1673. |
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| 作者姓名： | 郭树春 张艳芳 李素萍 邵盈 邢慧军 于海峰 |
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| 作者单位： | 内蒙古自治区农牧业科学院 作物科学研究所,内蒙古农业大学 园艺与植保学院,内蒙古自治区农牧业科学院 作物科学研究所,内蒙古自治区农牧业科学院,四子王旗林业和草原局,内蒙古自治区农牧业科学院 作物科学研究所 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金项目（32260514）；财政部和农业农村部国家现代农业产业技术体系资助（CARS-14-1-27）；内蒙古自治区科技计划项目（2021GG0014）；内蒙古自治区党委组织部2022年“西部之光”访问学者项目；2022年度内蒙古揭榜挂帅项目（2022JBGS0034）。 |
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| 摘 要： | 向日葵(Helianthus annuus L.)是世界四大油料作物之一。为解析向日葵主要脂肪酸组分的生物合成分子机制,选用高油酸自交系J9、低油酸自交系P50为研究材料；采用错期播种同期采样试验,以液相色谱测定授粉后不同样品籽粒的脂肪酸组分与含量；利用RNA-Seq技术,对不同样品测序,获得各样品与脂肪酸合成相关的基因表达数据,以气象学数据、液相色谱数据、向日葵基因组数据和转录组数据为基础,采用生物信息学方法分析相关数据。结果表明：(1)高油酸向日葵材料脂肪酸组分和含量受温度影响小,而低油酸材料易受温度影响；(2)J9和P50的12个样本的高表达基因数在7500个左右,而中、低表达基因数相当,是高表达基因的两倍,约15000个；(3)品种特异性表达基因和品种间特异表达基因去除重复后,在J9和P50在-CK和S数据集得到15885个,GO功能富集获得的与脂质代谢直接相关的403个DEGs 映射到与的脂质代谢相关的KEGG代谢通路,累计29个DEGs直接参与了19条相关KEGG通路。本研究将为深入解析向日葵脂肪酸代谢分子机制提供新信息。
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| 关 键 词： | 向日葵 脂肪酸 RNA-Seq 分子机制 |
| 收稿时间： | 2022/11/10 0:00:00 |
| 修稿时间： | 2023/7/13 0:00:00 |
Screening and Analysis of Fatty Acid Synthesis Genes in SunflowerBased on RNA Seq |
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| GUO Shuchun,ZHANG Yanfang,LI Suping,SHAO Ying,XING Huijun,YU Haifeng.Screening and Analysis of Fatty Acid Synthesis Genes in SunflowerBased on RNA Seq[J].Acta Botanica Boreali-Occidentalia Sinica,2023,43(10):1663-1673. |
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| Authors: | GUO Shuchun ZHANG Yanfang LI Suping SHAO Ying XING Huijun YU Haifeng |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Sunflower Fatty Acid RNA-Seq Molecular mechanism |
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