| 福州野生蕉FeSOD家族基因的克隆及在低温胁迫下的表达分析 |
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| 引用本文： | 冯 新,徐 蕾,赖恭梯,谢晓清,林玉玲,赖钟雄.福州野生蕉FeSOD家族基因的克隆及在低温胁迫下的表达分析[J].西北植物学报,2015,35(5):853-864. |
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| 作者姓名： | 冯 新 徐 蕾 赖恭梯 谢晓清 林玉玲 赖钟雄 |
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| 作者单位： | (福建农林大学 园艺植物生物工程研究所,福州 350002) |
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| 基金项目： | 国家香蕉产业技术体系专项资金(CARS-32-11);福建省农业科技平台(2008N2001) |
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| 摘 要： | 以抗寒性较强的福州野生蕉为材料,采用RACE和RT-PCR扩增得到铁超氧化物歧化酶(FeSOD)家族基因(FeSOD)的2个成员共4条转录本,分别命名为MuFSD1A(登录号JX844026)、MuFSD1B(登录号KJ786318)、MuFSD1B-variant1(登录号KJ786319)和MuFSD1B-variant2(登录号KJ786320)。MuFSD1A基因cDNA全长为1 277bp,编码300个氨基酸;MuFSD1B基因cDNA全长为1 378bp,编码260个氨基酸。基因结构分析表明MuFSD1B-variant1和MuFSD1B-variant2为MuFSD1B的可变剪接转录本。生物信息学和亚细胞定位分析显示,MuFSD1A和MuFSD1B主要定位于叶绿体,但他们的理化性质、磷酸化位点、蛋白结构等存在差异。序列比对分析发现MuFSD1A和MuFSD1B相似性仅为33.33%,但都具有保守的金属结合位点和FeSOD的特征氨基酸。进化树分析显示,MuFSD1A和MuFSD1B聚在不同的分支中。qRT-PCR分析表明,低温诱导MuFSD1A基因的表达而抑制MuFSD1B基因的表达,且MuFSD1A基因的相对表达量随着温度的降低而显著增加,说明该成员可能在香蕉抗寒中起主要作用。
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| 关 键 词： | 福州野生蕉 FeSOD家族基因 可变剪接 低温胁迫 基因表达 |
Clone and Expression Analysis under Cold Stress of FeSOD Family Genes from the Wild Banana in Fuzhou |
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| FENG Xin,XU Lei,LAI Gongti,XIE Xiaoqing,LIN Yuling,LAI Zhongxiong.Clone and Expression Analysis under Cold Stress of FeSOD Family Genes from the Wild Banana in Fuzhou[J].Acta Botanica Boreali-Occidentalia Sinica,2015,35(5):853-864. |
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| Authors: | FENG Xin XU Lei LAI Gongti XIE Xiaoqing LIN Yuling LAI Zhongxiong |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | wild banana in Fuzhou FeSOD family genes alternative splicing cold stress gene expression |
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