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利用荧光SSR标记鉴定茶树自然杂交后代遗传背景
引用本文:杨军,游小妹,陈常颂.利用荧光SSR标记鉴定茶树自然杂交后代遗传背景[J].西北植物学报,2023,43(12):1981-1993.
作者姓名:杨军  游小妹  陈常颂
作者单位:福建省农业科学院茶叶研究所,福建省农业科学院茶叶研究所,福建省农业科学院茶叶研究所
基金项目:农业高质量发展超越创新工程专项(XTCXGC2021004);福建省农业科学院科技创新团队(CXTD2021006-1);福建省公益类科研院所专项(2021R1029007)
摘    要:为研究茶树自然杂交后代遗传背景,分析不同茶树自然杂交后代遗传差异,本研究利用24对EST-SSR标记对82个茶树自然杂交后代和34个福建主要栽培品种进行分子标记,分析了茶树自然杂交后代的亲缘关系、群体遗传多样性、亲本模拟分析。结果表明:(1)24对SSR标记共检测到157个多态性位点,平均等位位点数为6.542个,Nei’s多样性指数平均为0.588,Shannon’s 信息指数平均为1.182,平均观测杂合度和期望杂合度分别为0.577和 0.591。(2)遗传距离聚类将个供试样品划分为4类,群体1主要为‘丹桂’及其自然杂交后代;群体2主要为‘丹桂’、‘黄观音’自然杂交后代与福建省乌龙茶品种;群体3主要为‘白鸡冠’及其自然杂交后代;群体4主要为福建省绿茶品种。(3)‘丹桂’、‘白鸡冠’、‘黄观音’自然杂交后代群体与福建主要栽培品种的遗传距离分别为0.079、0.117、0.107。(4)群体1亚群b内‘丹桂’自然杂交后代模拟亲本准确率为77.8%,模拟父本主要为福建乌龙茶品种,与群体2(亚群a)的遗传相似度、遗传分化系数、基因流分别为0.899、0.043、5.480。(5)AMOVA分析结果显示,有88.52%的遗传变异来自群体内部的个体间,表明遗传变异主要发生在群体内。

关 键 词:茶树  亲缘关系  亲本模拟  自然杂交  遗传背景
收稿时间:2023/6/9 0:00:00
修稿时间:2023/9/20 0:00:00

Genetic Background Identification of the Natural Hybrid Progenies of Tea on Fluorescently Labeled SSR
YANG Jun,YOU Xiaomei and CHEN Changsong.Genetic Background Identification of the Natural Hybrid Progenies of Tea on Fluorescently Labeled SSR[J].Acta Botanica Boreali-Occidentalia Sinica,2023,43(12):1981-1993.
Authors:YANG Jun  YOU Xiaomei and CHEN Changsong
Abstract:
Keywords:Tea plants  Genetic relationship  Parent simulation  Natural hybridization  genetic background
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