| 小麦TaLSD1锌指蛋白基因的电子克隆及序列分析 |
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| 引用本文： | 黄新杰,郭军,屈志鹏,黄丽丽,康振生.小麦TaLSD1锌指蛋白基因的电子克隆及序列分析[J].西北植物学报,2007,27(11). |
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| 作者姓名： | 黄新杰 郭军 屈志鹏 黄丽丽 康振生 |
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| 作者单位： | 西北农林科技大学,植物保护学院,陕西省农业分子生物学重点实验室,陕西杨陵,712100 |
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| 基金项目： | 教育部科技计划;教育部长江学者和创新团队发展计划;国家自然科学基金;高等学校学科创新引智计划 |
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| 摘 要： | 采用电子克隆与RT-PCR相结合的技术,在条锈菌(Pucciniastriiformis f.sp.tritici)侵染的小麦中克隆了一个LSD1型锌指蛋白基因,命名为TaLSD1(GenBank登录号为EF553327)。序列分析表明,该基因全长1024bp,编码生成1个包含3个保守LSD1型锌指结构(CxxCxRxxLMYxxGASxVxCxxC)且长度为146个氨基酸的多肽。进化树分析表明,TaLSD1与水稻(Oryza sativa)、拟南芥(Arabidopsis thaliana)和芜菁(Brassica rapa)中部分含有3个保守LSD1型锌指结构的同源基因亲缘关系较近,而与其它包含不同数目的LSD1型锌指结构基因亲缘关系较远。推测TaLSD1在进化中丢失了部分序列,进而执行新的功能。半定量RT-PCR结果显示,该基因在亲和以及非亲和组合中的表达模式很相似,均表现在前期基因表达被抑制而后期恢复正常。初步推测TaLSD1在转录水平上的表达受光诱导,同时,作为一个细胞程序性死亡的负调控因子在小麦与条锈菌互作过程中起作用。
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| 关 键 词： | 条锈菌 电子克隆 进化树分析 半定量RT-PCR LSD1型锌指结构 |
In Silico Cloning and Sequence Analysis of a TaLSD1 Zinc Finger Protein Gene from Wheat Infected by Stripe Rust Fungus |
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| HUANG Xin-jie,GUO Jun,QU Zhi-peng,HUANG Li-li,KANG Zhen-sheng.In Silico Cloning and Sequence Analysis of a TaLSD1 Zinc Finger Protein Gene from Wheat Infected by Stripe Rust Fungus[J].Acta Botanica Boreali-Occidentalia Sinica,2007,27(11). |
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| Authors: | HUANG Xin-jie GUO Jun QU Zhi-peng HUANG Li-li KANG Zhen-sheng |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | stripe rust fungus in silico cloning phylogenetic tree analysis semi-quantitative RT-PCR LSD1 type zinc finger motif |
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