蒺藜苜蓿LBD转录因子基因家族全基因组分析 |
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引用本文: | 贾喜涛,刘文献,谢文刚,刘志鹏,刘志敏,王彦荣.蒺藜苜蓿LBD转录因子基因家族全基因组分析[J].西北植物学报,2014,34(11):2176-2187. |
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作者姓名: | 贾喜涛 刘文献 谢文刚 刘志鹏 刘志敏 王彦荣 |
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作者单位: | (草地农业生态系统国家重点实验室,兰州大学 草地农业科技学院,兰州 730020) |
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基金项目: | 国家草品种区域试验项目(农财发[2013]49号);长江学者和创新团队发展计划(IRT13019);兰州大学中央高校基础研究基金项目(lzujbky-2013-82) |
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摘 要: | LBD是植物中所特有的转录因子基因家族,在调控植物侧生组织发育、营养代谢以及响应逆境胁迫等方面具有重要作用。该研究利用生物信息学手段,从全基因组水平筛选和鉴定了蒺藜苜蓿LBD基因家族,并对基因结构、系统进化、进化压力、保守域、染色体定位以及基因表达模式等进行了分析。研究结果共鉴定出2类5亚类共计56个蒺藜苜蓿LBD家族基因,在8条染色体上均有分布,但分布不均匀。该家族成员外显子数目都不超过2个,结构简单,基因间在进化时存在负向选择作用。基因表达模式分析发现,该家族成员的表达具有一定的时空特异性,并受干旱和氮素调控。该研究结果对蒺藜苜蓿LBD基因功能研究及进化分析具有重要的意义。
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关 键 词: | 蒺藜苜蓿 LBD转录因子 系统进化 基因表达分析 |
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