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云杉矮槲寄生遗传多样性及其群体遗传结构分析
引用本文:白云,陈磊,朱宁波,李学武,才让旦周,吴有林,田呈明.云杉矮槲寄生遗传多样性及其群体遗传结构分析[J].西北植物学报,2016,36(3):458-446.
作者姓名:白云  陈磊  朱宁波  李学武  才让旦周  吴有林  田呈明
作者单位:(1 北京林业大学 林学院,北京 100083;2 青海省森林病虫害防治检疫站,西宁 810000;3 青海省海东地区北山林场,青海海东 810500)
基金项目:国家“十二五”林业科技支撑项目(2012BAD19B0702);林业公益性行业科研专项(201204503)
摘    要:该研究采用CTAB法提取云杉矮槲寄生(Arceuthobium sichuanense)的基因组DNA,利用ITS1片段的序列信息对中国9个不同地理群体的62份云杉矮槲寄生样本的遗传多样性及群体遗传结构进行分析。结果表明:(1)62条ITS1序列共定义16个单倍型(H1~H16),表现出较低的遗传多样性水平(h=0.678 5,π=0.005 9),而群体间的遗传多样性水平则表现出较大差异(h=0~1.000 0,π=0~0.009 4);AMOVA分析显示云杉矮槲寄生群体内的遗传变异占到51.37%,群体间为48.63%。(2)Network单倍型网络分析表明,单倍型H1和H12较为古老,且所有群体对2种单倍型无共享现象;单倍型H1是广布单倍型,存在于青海和甘肃的6个群体中,单倍型H12仅在四川的2个群体中有分布。(3)基于最大似然法(ML)构建的群体聚类和中介邻接法构建的单倍型网络图均显示,四川的3个群体为独立类群,区别于青海、甘肃群体,且甘肃和青海的群体之间没有明显分化。该研究首次报道了云杉矮槲寄生遗传多样性和遗传结构,为进一步研究其进化及后续的病害防控提供了一定的参考。

关 键 词:云杉矮槲寄生  遗传多样性  群体遗传结构  单倍型

Genetic Diversity and Population Genetic Structure of Arceuthobium sichuanense
BAI Yun,CHEN Lei,ZHU Ningbo,LI Xuewu,CAIRANG Danzhou,WU Youlin,TIAN Chengming.Genetic Diversity and Population Genetic Structure of Arceuthobium sichuanense[J].Acta Botanica Boreali-Occidentalia Sinica,2016,36(3):458-446.
Authors:BAI Yun  CHEN Lei  ZHU Ningbo  LI Xuewu  CAIRANG Danzhou  WU Youlin  TIAN Chengming
Abstract:
Keywords:Arceuthobium sichuanense  genetic diversity  population genetic structure  haplotype
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