| 甘蓝型油菜RPD3/HDA1基因家族鉴定及早熟相关基因挖掘 |
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| 引用本文： | 张玉玲,张 超,蒋唤唤,梁峰豪,肖华贵,曾 兵.甘蓝型油菜RPD3/HDA1基因家族鉴定及早熟相关基因挖掘[J].西北植物学报,2023,43(6):901-911. |
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| 作者姓名： | 张玉玲 张 超 蒋唤唤 梁峰豪 肖华贵 曾 兵 |
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| 作者单位： | 贵州省油料研究所,贵州省油料研究所,贵州省油料研究所,贵州省油料研究所,贵州省油料研究所,贵州省油料研究所 |
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| 基金项目： | 早熟杂交油菜新品种黔油早2号中试与示范(黔科合成果[2020]1Y052); 贵州山区特色油料资源利用研究及实验平台建设(黔科中引地[2020] 4012号)；国家油菜产业技术体系(CARS-12);贵州省油菜产业技术体系(GZCYTX2018-08), |
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| 摘 要： | 该研究运用生物信息学方法鉴定甘蓝型油菜RPD3/HDA1基因家族,检测了其在‘黔油早2号’和‘中双11’中的表达水平及2个品种在低温(4℃)和ABA胁迫下该家族基因的表达特征,以探讨RPD3/HDA1基因在甘蓝型油菜中的潜在功能,为早熟油菜抗逆性遗传改良提供理论基础和候选基因。结果表明:(1)在甘蓝型油菜全基因组中共鉴定到28个RPD3/HDA1基因,将其命名为BnHDA1~BnHDA28,聚类为4个亚家族,同一亚家族成员的基因结构较为相似;在该基因家族中共检测到16对复制基因,均为片段重复。(2)顺式作用元件预测统计中共发现675个元件与植物激素、环境胁迫和光响应有关。(3)qRT-PCR分析显示,RPD3/HDA1基因在‘黔油早2号’中的表达量均高于‘中双11’;低温胁迫下,‘黔油早2号’和‘中双11’中RPD3/HDA1基因呈差异表达,与‘中双11’相比,RPD3/HDA1基因在‘黔油早2号’中的下调幅度较大;ABA处理后,RPD3/HDA1基因在2个品种中表达模式不一致,‘黔油早2号’中大部分RPD3/HDA1基因表达量较‘中双11’下调幅度小。研究认为,RPD3/HDA1基因可能在油菜开花中发挥调节作用,而且可能通过激素信号通路和防御信号通路参与油菜的生长发育和防御反应的调节。
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| 关 键 词： | 甘蓝型油菜 RPD3/HDA1家族 早熟 胁迫 表达分析 |
| 收稿时间： | 2022/12/19 0:00:00 |
| 修稿时间： | 2023/3/19 0:00:00 |
Identification of RPD3/HDA1 Gene Family in Brassica napus and Mining of Early Maturity Related Members |
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| ZHANG Yuling,ZHANG Chao,JIANG Huanhuan,LIANG Fenghao,XIAO Huagui,ZENG Bing.Identification of RPD3/HDA1 Gene Family in Brassica napus and Mining of Early Maturity Related Members[J].Acta Botanica Boreali-Occidentalia Sinica,2023,43(6):901-911. |
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| Authors: | ZHANG Yuling ZHANG Chao JIANG Huanhuan LIANG Fenghao XIAO Huagui ZENG Bing |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Brassica napus L RPD3/HDA1 family precocity stress expression analysis |
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