| 龙眼胚性愈伤组织DlGRAS4与DlGRAS54基因的克隆及表达分析 |
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| 引用本文： | 陈裕坤,林玉玲,田奇琳,林丽霞,赖瑞联,赖钟雄.龙眼胚性愈伤组织DlGRAS4与DlGRAS54基因的克隆及表达分析[J].西北植物学报,2014,34(2):215-224. |
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| 作者姓名： | 陈裕坤 林玉玲 田奇琳 林丽霞 赖瑞联 赖钟雄 |
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| 作者单位： | (福建农林大学 园艺植物生物工程研究所,福州 350002) |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金(31272149);国家自然科学基金(31071787);高等学校博士学科点专项科研基金(20093515110005);福建省科技平台建设项目(2008N2001) |
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| 摘 要： | 以龙眼松散型胚性愈伤组织为实验材料,采用RT-PCR结合RACE法,克隆了植物特异转录调控因子DlGRAS4和DlGRAS54的cDNA全长序列和DNA序列,并进行生物信息学以及表达分析。结果表明:DlGRAS4全长1 668bp,开放阅读框(ORF)1 296bp,编码431个氨基酸(GenBank登录号:KC127683);DlGRAS54全长2 113bp,ORF 1 659bp,编码552个氨基酸(GenBank登录号:KC127684);DlGRAS54的DNA序列在5′-UTR含有1个1 533bp的内含子。生物信息学分析表明:DlGRAS4和GRAS54是不稳定亲水蛋白,不含信号肽,具有跨膜结构和GRAS家族的保守结构域,亚细胞定位于细胞膜中;与毛果杨、葡萄、蓖麻和可可等具有较高的同源性。系统进化树分析显示,DlGRAS54与拟南芥AtPAT1、葡萄VvPAT1、毛果杨PtPAT1、大豆GmPAT1处于同一分枝;DlGRAS4与拟南芥AtSCL23、玉米ZmSCL23处于同一分枝。推测DlGRAS4和DlGRAS54是GRAS基因家族的成员。qPCR结果表明,DlGRAS4在整个发育阶段转录水平呈"W"型变化趋势,在球形胚和子叶形胚阶段的表达量达最大值;DlGRAS54在整个发育阶段的转录水平呈"M"型变化趋势,在球形胚和鱼雷形胚阶段表达量达最大值,表明DlGRAS4和DlGRAS54主要在发育的中晚期起作用。外源赤霉素处理后DlGRAS4和DlGRAS54的表达量明显上调,说明DlGRAS4和DlGRAS54对赤霉素处理能做出积极的反应。
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| 关 键 词： | 龙眼 体细胞胚胎发生 GRAS 克隆 生物信息学 实时荧光定量PCR |
Cloning and Expression Analysis of DlGRAS4 and DlGRAS54 from Embryogenic Callus of Dimocarpus longan Lour. |
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| CHEN Yukun,LIN Yuling,TIAN Qilin,LIN Lixi,LAI Ruilian,LAI Zhongxiong.Cloning and Expression Analysis of DlGRAS4 and DlGRAS54 from Embryogenic Callus of Dimocarpus longan Lour.[J].Acta Botanica Boreali-Occidentalia Sinica,2014,34(2):215-224. |
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| Authors: | CHEN Yukun LIN Yuling TIAN Qilin LIN Lixi LAI Ruilian LAI Zhongxiong |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | longan somatic embryogenesis GRAS cloning bioinformatics qPCR bioinformatics analyzing |
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