| 燕麦盐胁迫响应基因的差异表达与生理响应的关系 |
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| 引用本文： | 高彩婷,刘景辉,徐寿军,张玉芹,于华荣.燕麦盐胁迫响应基因的差异表达与生理响应的关系[J].西北植物学报,2015,35(7):1385-1393. |
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| 作者姓名： | 高彩婷 刘景辉 徐寿军 张玉芹 于华荣 |
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| 作者单位： | (1 内蒙古农业大学 农学院,呼和浩特 010019;2 内蒙古民族大学 农学院,内蒙古通辽 028000) |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金(31060174,30660084);内蒙古自然科学基金(2010Zd07,200607010301);国家现代农业产业技术体系建设专项(CARS-08-B-5);内蒙古农业大学科技创新团队项目(NDTD2010-8) |
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| 摘 要： | 以耐盐燕麦品种VAO-9为材料,通过Illumina测序与数字基因表达谱技术对300mmol/L NaCl处理前后的叶片cDNA文库进行RNA-Seq与DGE分析,同时测定0(CK)、100、200、250、300mmol/L NaCl胁迫下VAO-9幼苗叶片的相对电导率、丙二醛含量和脯氨酸含量,探讨燕麦盐胁迫响应基因的差异表达与生理响应的关系。结果表明:(1)RNA-Seq分析得到Unigenes 65 801条,其基因表达呈现高度的不均一性和冗余性;若差异基因表达谱鉴定分析以log2Ratio≥2且FDR值≤0.001为选择标准,则发现上调和下调表达基因在胁迫0.5h时分别有306和64个,在胁迫3h时分别有639和290个,胁迫24h时分别有1 488和882个。(2)KEGG代谢分析显示,有23 652条Unigenes比对到KEGG中的128条代谢途径,包括与逆境胁迫相关的植物激素信号转导途径、ABC转运蛋白途径、肌醇磷酸代谢途径、渗透调节途径等。(3)在300mmol/L NaCl处理下燕麦叶片的相对电导率、丙二醛含量、脯氨酸含量等生理指标的变化与相关差异表达基因的变化趋势基本一致,说明基因差异表达量与生理反应密切相关。研究认为,在相同的栽培及胁迫处理条件下,可根据植物盐响应生理指标的变化判断耐盐基因的表达情况。
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| 关 键 词： | 燕麦 盐胁迫 Illumina 测序 表达谱 生理响应 |
Exploring the Relationship of Differentially Expressed Genes and Physiological of Oats in Response to Salt Stress |
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| GAO Caiting,LIU Jinghui,XU Shoujun,ZHANG Yuqin,YU Huarong.Exploring the Relationship of Differentially Expressed Genes and Physiological of Oats in Response to Salt Stress[J].Acta Botanica Boreali-Occidentalia Sinica,2015,35(7):1385-1393. |
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| Authors: | GAO Caiting LIU Jinghui XU Shoujun ZHANG Yuqin YU Huarong |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Oat salt stress Illumina sequencing digital expression profiling physiological response |
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