| 37份新疆粳稻品种(系)的IRAP遗传多样性分析 |
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| 引用本文： | 贾春平,张燕红,袁 杰,赵志强,王奉斌.37份新疆粳稻品种(系)的IRAP遗传多样性分析[J].西北植物学报,2017,37(6):1102-1110. |
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| 作者姓名： | 贾春平 张燕红 袁 杰 赵志强 王奉斌 |
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| 作者单位： | (新疆农业科学院，核技术生物技术研究所，乌鲁木齐 830091) |
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| 基金项目： | 新疆维吾尔自治区自然科学基金（2016D01A046） |
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| 摘 要： | 该研究基于4个稻属(Oryza)反转录转座子,包括活性、低拷贝Tos17/Osr21(Ty1-copia)和RIRE7/Osr31(Ty3-gypsy)]和非活性、高拷贝Osr34(Ty3-gypsy)和Houba/Tos5/Osr13(Ty1-copia)],在两侧翼长末端重复序列(LTR)区域分别设计引物,对37份新疆粳稻(Oryza sativa L.ssp.japonica)栽培品种(系)进行PCR扩增。评估鉴定适用于反转录转座子插入位点间扩增多态性(IRAP)标记方法,并分析37份供试品种(系)的遗传多样性。(1)PCR扩增结果显示,Tos17/Osr21、RIRE7/Osr31、Osr34和Houba/Tos5/Osr13依次获得73、63、107和560条谱带,其中多态性条带36、63、70和523个,多态性比率为49.3%、100.0%、65.4%和93.4%。(2)综合评估比较多态性、异质性、总谱带数和平均多态性谱带数发现,Houba/Tos5/Osr13适用于IRAP标记方法构建DNA指纹图谱数据库。(3)以Houba/Tos5/Osr13遗传相似系数为基础,对供试品种(系)采用非加权平均(UPGMA)法进行聚类分析显示,以0.55为阈值将37份新疆粳稻栽培品种(系)分为6大类群,绝大多数品种(系)得到了明确的区分,品种间的遗传相似性较高,多样化程度偏低;品系‘20-18’和‘96-16’分别各自聚为一类,表明品系与品种间遗传背景较远,多样化程度较高。综上所述,IRAP分子标记适用于新疆粳稻种质资源的亲缘关系分析、鉴别及育种遗传距离的判定和DNA指纹图谱数据库构建等相关研究,在实际育种中选取不同类群的水稻品种与品系进行杂交选育,成功率较高,可能会大大缩短优良品种的选育进程。
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| 关 键 词： | 新疆粳稻 反转录转座子 IRAP 种质资源 遗传多样性 |
IRAP Analysis Genetic Diversity of 37 Oryza sativa L. ssp. japonica Varieties (Strains) in Xinjiang |
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| JIA Chunping,ZHANG Yanhong,YUAN Jie,ZHAO Zhiqiang,WANG Fengbin.IRAP Analysis Genetic Diversity of 37 Oryza sativa L. ssp. japonica Varieties (Strains) in Xinjiang[J].Acta Botanica Boreali-Occidentalia Sinica,2017,37(6):1102-1110. |
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| Authors: | JIA Chunping ZHANG Yanhong YUAN Jie ZHAO Zhiqiang WANG Fengbin |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Oryza sativa L ssp japonica in Xinjiang retrotransposons IRAP germplasm resources genetic diversity |
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