| 异育银鲫GABA A受体γ2亚基全长克隆及生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 赵依妮,胡鲲,孙琪,杨先乐,阮记明,周爱玲.异育银鲫GABA A受体γ2亚基全长克隆及生物信息学分析[J].生物技术通报,2015(3):191-198. |
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| 作者姓名： | 赵依妮 胡鲲 孙琪 杨先乐 阮记明 周爱玲 |
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| 作者单位： | 上海海洋大学国家水生动物病原库;上海黛龙生物科技工程有限公司 |
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| 基金项目： | 国家科学自然基金项目(31172430);“863”计划项目(2011AA10A216);公益性农业行业专项项目(201203085) |
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| 摘 要： | 近年来GABA A受体亚基特异性在药物筛选、研发过程中的应用得到广泛地关注,其中有关α1、β2和γ2三种功能性亚基的研究最为深入。异育银鲫因其良好的生长、繁殖优势,在国内得到广泛养殖。采用RACE法克隆得到了异育银鲫GABA A受体γ2亚基基因全长cDNA,并进行了生物信息学分析。该基因长2 763 bp,其中CDS区长1437 bp,可编码477个氨基酸的前体蛋白。预测蛋白分子量55.3 k D,理论等电点9.13。异育银鲫体内GABA A受体γ2亚基氨基酸序列N端存在1个长度为35个氨基酸的信号肽,4个长度分别为23、20、23和23个氨基酸的跨膜区,3个N-糖基结合位点和2个O-糖基化位点,1个特异性结构域,其氨基酸序列具有明显的氯离子门控通道家族特征。氨基酸序列与其他物种氨基酸序列的同源性都在89%以上,表明该蛋白属于GABA A受体亚基家族。系统进化树表明异育银鲫与斑马鱼聚为一支,亲缘关系最近。
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| 关 键 词： | 异育银鲫 GABA A受体γ2亚基 克隆 生物信息学分析 |
Cloning and Bioinformatics Analysis of GABAA Receptorγ2 Subunit Gene inCarassais auratus gibebiol |
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| Zhao Yini;Hu Kun;Sun Qi;Yang Xianle;Ruan Jiming;Zhou Ailing.Cloning and Bioinformatics Analysis of GABAA Receptorγ2 Subunit Gene inCarassais auratus gibebiol[J].Biotechnology Bulletin,2015(3):191-198. |
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| Authors: | Zhao Yini;Hu Kun;Sun Qi;Yang Xianle;Ruan Jiming;Zhou Ailing |
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| Institution: | Zhao Yini;Hu Kun;Sun Qi;Yang Xianle;Ruan Jiming;Zhou Ailing;State Collection Center of Aquatic Pathogen,Shanghai Ocean University;Delon Hi-Tech Ltd.; |
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