| 刺参管足SMART cDNA文库构建及EST分析 |
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| 引用本文： | 李栋,常亚青,王玉丹,丁君.刺参管足SMART cDNA文库构建及EST分析[J].生物技术通报,2011(9). |
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| 作者姓名： | 李栋 常亚青 王玉丹 丁君 |
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| 作者单位： | 大连海洋大学农业部海洋水产增养殖学重点开放实验室,大连,116023 |
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| 基金项目： | 国家”863”计划项目(2006AA10A411,2010AA10A401) |
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| 摘 要： | 以大连广鹿岛野生刺参的管足mRNA为材料,利用SMART cDNA Construction Kit构建了表达型cDNA文库.初始文库的滴度为1.3 × 106PFU/mL,蓝白斑估测量组率合格.扩增后获得96 mL文库,滴度为1.8 × 1010PFU/mL,从扩增文库中随机挑取200个噬菌斑进行PCR检测,电泳检测结果表明重组率大于90％,片段大小在0.25 -2.0 kb之间的插入片段占80.4％,文库构建成功.随机选择122个噬菌斑转化为质拉pTriplEx2并测序,测序成功率83.6％,软件处理后100 bp以上的clean ESTs有72条,测通的为65条,占成功测序样品的63.7％.72条序列经SeqMan软件拼接,获得48条conting/singletons,在线Blast比对发现其中26条具有同源序列并获得注释,另外20条可能为新基因,其功能和结构有待进一步利用生物信息学的方法进行分析和研究.
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| 关 键 词： | 刺参 管足 cDNA文库 EST分析 |
Construction of SMART cDNA Library from Tube Foot of Sea Cucumber (Apostichopus japonicus) and EST Analysis |
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| Li Dong,Chang Yaqing,Wang Yudan,Ding Jun.Construction of SMART cDNA Library from Tube Foot of Sea Cucumber (Apostichopus japonicus) and EST Analysis[J].Biotechnology Bulletin,2011(9). |
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| Authors: | Li Dong Chang Yaqing Wang Yudan Ding Jun |
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| Institution: | Li Dong Chang Yaqing Wang Yudan Ding Jun(Ministry of Agriculture Key Laboratory of Mari Culture,Dalian Ocean University,Dalian 116023) |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Apostichopus japonicus Tube foot cDNA library EST analysis |
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