不同鲜食品质橄榄果实转录组测序及酚类代谢途径相关调控基因挖掘 |
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引用本文: | 谢倩,江来,贺进,刘玲玲,丁明月,陈清西.不同鲜食品质橄榄果实转录组测序及酚类代谢途径相关调控基因挖掘[J].生物技术通报,2024(3):215-228. |
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作者姓名: | 谢倩 江来 贺进 刘玲玲 丁明月 陈清西 |
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作者单位: | 福建农林大学园艺学院 |
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基金项目: | 福建省现代农业产业技术体系建设专项(闽财教指[2021]61号); |
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摘 要: | 【目的】果实酚类物质类别、含量是与橄榄营养及风味密切相关的重要品质性状,探究橄榄酚类物质生物合成的分子调控机制。【方法】以总酚含量差异显著的橄榄(低酚/高酚)为试材,分别取花后80-160 d的果实进行转录组分析,对莽草酸-水解单宁/苯丙烷-类黄酮生物合成通路差异基因进行表征,并对差异表达基因进行WGCNA分析,从中挖掘与酚类代谢途径相关的转录因子。【结果】转录组测序共获得296 314条Unigene,其中73%的Unigene被注释到数据库;4个品种(系)橄榄成熟果共鉴定到1 628个差异表达基因(DEGs),KEGG分析显示,DEGs在酚类代谢途径的“类黄酮生物合成”通路上显著富集;进一步对果实成熟过程莽草酸-水解单宁/苯丙烷-类黄酮生物合成途径的DEGs进行表征,结合WGCNA分析中每个模块与性状的R2和P值,筛选到4个关键模块,根据模块内基因的调控关系利用MCC拓扑分析法以度值≥1挖掘模块内关键转录因子,挖掘到137个转录因子Unigene与30个酚类合成结构基因Unigene共表达,转录因子Unigene功能注释来自35个基因家族,最多的为锌指蛋白(C2C2、C3H、C2H...
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关 键 词: | 橄榄 转录组 酚类代谢途径 转录因子 |
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