猕猴桃过氧化氢酶基因家族全基因组鉴定与表达分析 |
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引用本文: | 赖瑞联,冯新,高敏霞,路喻丹,刘晓驰,吴如健,陈义挺.猕猴桃过氧化氢酶基因家族全基因组鉴定与表达分析[J].生物技术通报,2023(4):136-147. |
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作者姓名: | 赖瑞联 冯新 高敏霞 路喻丹 刘晓驰 吴如健 陈义挺 |
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作者单位: | 福建省农业科学院果树研究所 |
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摘 要: | 过氧化氢酶(Catalase,CAT)是植物主要的抗氧化酶之一。为揭示猕猴桃CAT(AcCAT)基因家族序列特征和潜在功能,对其进行了全基因组鉴定和表达分析。对AcCAT基因家族进行全基因组鉴定和生物信息学分析,并研究其在不同器官以及果实贮藏过程中的表达变化。从猕猴桃基因组中鉴定出9个AcCAT基因并根据其在染色体上的位置分别命名为AcCAT1-AcCAT9,不同成员之间蛋白理化性质、基因结构、保守基序、启动子作用元件等存在较高相似性。AcCAT基因不均匀地分布在猕猴桃的4条染色体上,其中的5个AcCAT基因形成2个串联基因簇,6个AcCAT基因发生片段复制。基于psRNAtarget分析,AcCAT基因可能主要受miR166家族调控。系统进化分析结果显示,来源于猕猴桃、茶树、棉花和水稻的23个CAT蛋白分为3个类群,其归类并未完全按物种划分。在不同猕猴桃器官中,AcCAT3主要在根中表达,AcCAT1和AcCAT4主要在花中表达,AcCAT2、AcCAT5、AcCAT6、AcCAT8和AcCAT9主要在叶中表达,AcCAT7则同时在根和花中高水平表达;在猕猴桃果实贮藏过程中,AcCA...
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关 键 词: | 猕猴桃 过氧化氢酶 全基因组鉴定 基因表达 |
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