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美丽硬仆骨舌鱼mtDNA D-loop区遗传变异特征
引用本文:牟希东,宋红梅,汪学杰,杨叶欣,罗渡,顾党恩,罗建仁,胡隐昌.美丽硬仆骨舌鱼mtDNA D-loop区遗传变异特征[J].生物技术通报,2012,0(9):185-190.
作者姓名:牟希东  宋红梅  汪学杰  杨叶欣  罗渡  顾党恩  罗建仁  胡隐昌
作者单位:中国水产科学研究院珠江水产研究所农业部热带亚热带水产资源利用与养殖重点实验室,广州,510380
基金项目:国家科技基础条件平台子项目;广东省科技计划项目
摘    要:采用直接测序法分析美丽硬仆骨舌鱼(Scleropages formosus)3个种群(金龙鱼、红龙鱼和青龙鱼)共24个个体的线粒体D-loop区的遗传变异特征。经序列比对、分析,金龙鱼、红龙鱼和青龙鱼的D-loop序列不仅在个体间存在位点序列的变异(17个简约性信息位点),而且还存在序列长度的多态性(长度为915-924 bp),这种长度的差异在于存在不同碱基长度的微卫星序列。3种龙鱼碱基组成基本一致,G含量偏低。定义了10种单倍型,但金龙鱼、红龙鱼和青龙鱼间没有共享单倍型,单倍型多样度较高(0.667-1.00),核苷酸多样度较低(0.001 09-0.003 23)。AMOVA分析显示,变异主要来自地理区内不同群体间,个体间遗传距离为0-0.008 7,显示遗传变异仍处于种内水平。NJ、MP和Bayesian构建的分子系统树拓扑结构基本一致,但不能有效地反映金龙鱼、红龙鱼和青龙鱼间的亲缘关系。

关 键 词:美丽硬仆骨舌鱼  mtDNA  D-loop  遗传变异

Genetic Variability of Scleropages formosus Based on Mitochondrial DNA D-loop
Mu Xidong , Song Hongmei , Wang Xuejie , Yang Yexin , Luo Du , Gu Dang'en , Luo Jianren , Hu Yinchang.Genetic Variability of Scleropages formosus Based on Mitochondrial DNA D-loop[J].Biotechnology Bulletin,2012,0(9):185-190.
Authors:Mu Xidong  Song Hongmei  Wang Xuejie  Yang Yexin  Luo Du  Gu Dang'en  Luo Jianren  Hu Yinchang
Institution:Mu Xidong Song Hongmei Wang Xuejie Yang Yexin Luo Du Gu Dang’en Luo Jianren Hu Yinchang(Pearl River Fisheries Research Institute,CAFS,Key Laboratory of Tropical & Subtropical Fishery Resource Application & Cultivation,Ministry of Agriculture,Guangzhou 510380)
Abstract:
Keywords:
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